Ubuntu12.04 安装 LAMMPS GPU 并行版

最新推荐文章于 2024-05-27 15:28:32 发布

唐晓畅

最新推荐文章于 2024-05-27 15:28:32 发布

阅读量6.4k

点赞数

分类专栏：软件安装方法文章标签： ubuntu lammps gpu cuda linux

本文链接：https://blog.csdn.net/txcokokok/article/details/47053499

版权

本文档详细介绍了在Ubuntu 12.04系统上，如何安装CUDA 7.0、OpenMPI 1.8.2、fftw 3.3.4、以及LAMMPS 15May15的GPU并行版本。首先，安装CUDA并设置环境变量，接着安装OpenMPI和fftw，然后添加环境变量。再安装LAMMPS并针对不同包进行编译，最后测试GPU并行运行。

摘要由CSDN通过智能技术生成

安装前请先参考https://blog.csdn.net/txcokokok/article/details/42219099安装环境包。

系统：Ubuntu 12.04
GPU：Nvidia Geforce Titan X
其他：Openmpi-1.802 + fftw-3.3.4 + lammps-15May15 + CUDA-7.0

一.安装cuda
1.下载cuda-repo-ubuntu1204-7-0-local_7.0-28_amd64.deb
2.运行
3.sudo gedit /etc/bash.bashrc
末尾插入：
export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH

二.安装openmpi
cd /home/txc/package
tar jxvf openmpi-1.8.2.tar.bz2
cd openmpi-1.8.2
./configure -prefix=/opt/openmpi
sudo make install -j 8

三.安装fftw
cd ..
tar zxvf fftw-3.3.4.tar.gz
cd fftw-3.3.4
./configure -prefix=/opt/fftw
sudo make install -j 8

四.添加环境变量
sudo gedit /etc/bash.bashrc
末尾插入：
export MPI=/opt/openmpi
export PATH=$MPI/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$MPI/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export MANPATH=$MANPATH:$MPI/share/man
export INFOPATH=$INFOPATH:$MPI/share/man

export LD_LIBRARY_PATH=/opt/fftw/lib:$LD_LIBRARY_PATH

五.安装lammps

可以通过

make package-status

查看packages的选择状态

1.meam包
cd /home/txc/install/lammps-15May15/lib/meam
make -f Makefile.gfortran

2.poems包
cd ../poems
make -f Makefile.g++

3.reax包
cd ../reax
make -f Makefile.gfortran

4.gpu包
cd ../gpu
更改Makefile.linux（见附件）
（注：
CUDA_ARCH = -arch=sm_52 这里一定要根据自己的显卡设置，这里设置52是因为 Titan X的计算能力（compute capability）为5.2，3.0就设置30。

可以用以下命令查看：
cd /usr/local/cuda-7.0/samples/1_Utilities/deviceQuery
.