Ubuntu安装生物软件

目录

1、安装WSL

2、安装miniconda

3、安装生物软件


1、安装wsl

        设置中搜索控制面板->程序->程序和功能->启动或关闭Windows系统

         进入微软商店下载ubuntu,默认会下载在C盘。

        第一次打开Ubuntu需要设置自己的用户名和密码。

注:用户名首字母不要大写

出现的错误:

 解决方法:

按win+x,选择Windows PowerShell(管理员),输入命令:wsl --set-default-version 1,切换wsl版本

2、安装miniconda

下载miniconda:

        去清华镜像下载对应的miniconda;

        清华镜像官网:

                https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda(选择liunx版本,我下载的最新版本)

安装miniconda:

        在根目录下,使用cd ./mnt/[安装文件路径]

        安装命令:bash 安装包名

        安装过程中,需要输入三次yes(后两次根据个人需要,一般新手安装,建议选择yes);

        最后重新启动Ubuntu才能让conda生效;

        输入:conda --version,显示相应版本,说明conda安装成功

        指令:conda config --set auto_activate_base false;这个指令控制重新打开Ubuntu是否自动激活base环境。

        指令:

//进入base环境
source ~/miniconda3/bin/activate
//退出base环境
conda deavtivate 

     创建环境:

//创建python3.8环境
conda create -n EnvName python-3.8 -y
//查看现有虚拟环境
conda env list
//激活EnvName环境
conda activate EnvName

3、安装生物软件

        以primedrpa为例

        输入命令:conda install -c bioconda primedrpa

        命令:conda list ,查看安装成功的软件

进入相应的虚拟环境

命令:软件名 ,进入相应软件。

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