基于深度学习的药物发现：使用GCN或DMPNN模型在ChEMBL数据集上进行药物发现任务

最新推荐文章于 2024-09-13 10:27:31 发布

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分类专栏： 2024年机器学习&深度学习千例文章标签：深度学习人工智能 python

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_68036862/article/details/130444274

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本文介绍如何使用GCN和DMPNN模型在ChEMBL数据集上进行药物发现任务。通过Python预处理数据，构建模型并训练，探讨性能改进策略，包括数据增强、更深网络结构等。同时，讨论了这种方法在新药开发、生物活性预测等领域的应用。

摘要由CSDN通过智能技术生成

欢迎来到本篇博客！在这篇文章中，我们将探讨如何使用图卷积网络（GCN）和深度分子传递网络（DMPNN）在ChEMBL数据集上进行药物发现任务。我们将用Python语言编写代码，并将一步步地解释每个部分。

首先，让我们安装必要的库。为了实现这一目标，我们需要以下库：

安装这些库的方法如下：

conda create -n my-rdkit-env -c conda-forge rdkit
conda activate my-rdkit-env
pip install tensorflow deepchem

接下来，我们需要下载ChEMBL数据集。您可以在这个链接下载数据集。

下载数据集后，我们需要进行一些预处理，以便将其输入到我们的模型中。以下是我们将遵循的步骤：

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