Day7-木婉清-测序知识-2024.2.4

一、测序原理illumina

https://www.jianshu.com/p/101c14c3a1d2 文章《测序的世界》 很好很重要涉及到质控和过滤
原理介绍视频：https://share.weiyun.com/5qojuBY 密码： 密码：bxsry4

测序：

测序数据原理以及格式介绍：
fastq
fasta
GenBank &
EMBL
介绍了数据格式以及怎么转化这些格式

https://mp.weixin.qq.com/s/zPa2G5gzl-sTFAi-qAzbvA

二、不同测序方法

第三代测序法具体介绍：

https://mp.weixin.qq.com/s/LSRlRYXWETVec2uP5kh87w

**SMART(**边合成边测序，同时比较相邻碱基测的时间和峰来发现是否存在甲基化等修饰）
PacBio 实时单分子测序

纳米孔（该技术的原理是当在膜两侧施加电压，分子马达驱动DNA分子通过纳米孔，导致电荷发生变化，每种碱基引起的电流变化是不同的，通过检测这些电流进而转化为对应的碱基序列。）

Ion Torrent电子流检测技术
这也是新一代测序技术中并不用到荧光检测的一种，它检测的是在合成过程中，不同碱基加入而释放出的不同强弱的离子流

Complete Genomics

测序历史：https://mp.weixin.qq.com/s/GReWY8yq7O_xVnajknrHZQ

微信学习【陈巍学基因】视频1