今天中午想安装Y叔的ReactomePA包,结果倒腾了一下午,都没安装上。
因为我先
>BiocManager::install("ReactomePA")
唉,太慢了,耗时一小时,按提示全部更新附属包
最后提示没安装"reactome.db"包
行吧,再次安装
>BiocManager::install("reactome.db")
但是!这包436M,巨大也巨慢,没几小时都不行,切换镜像也没用
行吧,手动下载好了
运行上面那个代码会给出一个网址的,类似是“http://CRAN../reactome.db_1.82.0.tar.gz"
(运行记录被我清掉了)
直接复制到百度进行下载,一定要挂个梯!!下载直接2分钟搞定!
我下载到D盘的一个路径,接着跑
>install.packages("D:/Doctor/LMRGs/reactome.db_1.82.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
>library(reactome.db)
>BiocManager::install("ReactomePA")
>library(ReactomePA)
成功装上啦!!