【R语言+Gephi】利用R语言和Gephi实现共发生网络的可视化
注:本文仅作为自己的学习记录以备以后复习查阅
一 概述
Gephi是一款开源免费的多平台网络分析软件,在Windows、Linux和Mac os上均可以运行,像他们官网所说的,他们致力于创造像Photoshop一样的图表绘制软件。
软件特点如下:
符合人体工程学的界面:无需编程技能
高性能:内置渲染引擎。
原生文件格式:GDF (GUESS)、GraphML (NodeXL)、GML、NET (Pajek)、GEXF 等。
可通过插件进行自定义:布局、指标、数据源、操作工具、渲染预设等。
Gephi官方下载地址:https://gephi.org/users/download/
二 Gephi网络可视化及美化
在Gephi中我们可以通过边文件
和点文件
创建网络图,步骤如下:
此时可以对网络图进行美化,Fruchterman Reingold
是最常用的网络布局,当然大家也可以试试看其他的布局运行出来是什么样的。
在统计模块,我们可以进行如下图所示的计算,这些也是比较常用的,大家可以根据自己的需求进行计算: