vsearch的下载

最新推荐文章于 2024-05-19 09:53:58 发布
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分类专栏： linux 文章标签： vsearch 16s
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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_22884761/article/details/102692705
版权

下载安装

wget https://github.com/torognes/vsearch/archive/v2.14.1.tar.gz
tar xzf v2.14.1.tar.gz
cd vsearch-2.14.1
./autogen.sh
./configure
make
make install  # as root or sudo make install
狗蛋儿张
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vSearch-开源
07-27
vSearch 是一个内部搜索引擎，可部署在任何面向 SQL 的站点上。 它可以缩放以匹配任何规模的站点，该站点具有易于更新的 cron 脚本，并适用于关键字密度、权重、匹配和短语匹配。
Vsearch安装
m0_53945548的博客
01-15 634
【代码】Vsearch安装。
推荐神器：VSEARCH —— 开源的序列比对与处理新选择
最新发布
gitblog_00055的博客
05-19 379
推荐神器：VSEARCH —— 开源的序列比对与处理新选择 项目地址:https://gitcode.com/torognes/vsearch 在生物信息学领域，对于大规模基因序列数据的处理和分析是日常工作的重要部分。今天，我们向您推荐一款强大的开源工具——VSEARCH，它是一个设计精良且功能丰富的序列比对工具，旨在成为USEARCH的优秀替代品。 项目介绍 VSEARCH是一个64位的、高效能...
vsearch:用于微生物组分析的多功能开源工具
04-28
VSEARCH 介绍 该项目的目的是创建由Robert C. Edgar（2010）开发的工具的替代方案。 新工具应： 具有适当的开源许可证的开源代码 免费，免费 采用64位设计，可以处理非常大的数据库和超过4GB的内存 与usearch一样准确或更准确 比usearch快或快 我们已经实现了一个称为VSEARCH的工具，该工具支持基于从头和参考的嵌合体检测，聚类，全长和前缀去重复，重复复制，反向互补，掩蔽，全对全成对全局比对，精确和全局比对搜索，混排，二次抽样和排序。 它还支持FASTQ文件分析，过滤，转换和合并成对的末端读取。 VSEARCH代表矢量化搜索，因为该工具利用SIMD矢量化形式的并行性以及多个线程来高速执行精确对齐。 与默认情况下使用启发式种子和扩展对齐器的USEARCH相比，VSEARCH使用了最佳的全局对齐器（完全动态编程Needleman-Wunsch）。 这通常
vsearch-1.0.tar_nuts1x4_foreign8x8_centerq3i_vsearch_yesterday2u
09-30
搜索特定文字，可以帮助我们快速的找到我们想要寻找的字符。
VSEARCH操作实战-免费使用无内存限制的USEARCH！
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
03-09 1966
前言前面宏基因组公众号号推送过关于USEARCH的介绍及使用，详情见文章：扩增子分析神器USEARCH简介。USEARCH软件在扩增子测序分析上堪称神器！该软件依靠大神Robert Ed...
elasticsearch下载
10-08
ElasticSearch是一个基于Lucene的搜索服务器。它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎，基于RESTful web接口。Elasticsearch是用Java开发的，并作为Apache许可条款下的开放源码发布，是当前流行的企业级搜索...
elasticsearch 下载 7.x
02-18
Elasticsearch是一个强大的开源搜索引擎，基于Lucene库构建，被广泛应用于数据分析、日志收集、实时搜索等多个领域。它的特点是分布式的、实时的、可扩展的，并且具有高可用性和容错性。在7.x版本中，Elasticsearch...
elasticsearch的镜像，外网下载太慢了！
11-02
elasticsearch的镜像
elasticsearch-5.3.1 下载
05-01
- 下载完成后，解压 `elasticsearch-5.3.1` 压缩包，运行相应的启动脚本（如 `bin/elasticsearch`），即可启动服务。 - 配置文件位于 `config/elasticsearch.yml`，可以根据需求修改集群名称、节点角色、内存分配...
elasticsearch7.14.0.zip
01-03
Elasticsearch 7.14.0 是一个高度可扩展的全文搜索引擎，广泛应用于日志分析、实时数据分析和全文检索等多个领域。这个压缩包包含了针对Windows和Linux操作系统的安装包，便于在不同环境下部署和使用Elasticsearch。...
vsearch2.8.1使用和命令简介——中文帮助文档(免费64位版usearch)
热门推荐
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
08-06 1万+
简介 主要功能和命令行格式 嵌合体检测 聚类 去冗余 序列操作 屏蔽序列 两两比对 搜索 重排与排序 抽样 物种分类 处理UDB数据库索引 描述 输入 参数 通用参数 嵌合体检测参数 聚类参数 序列去冗余 屏蔽序列选项 成对比对选项 搜索选项 洗牌参数 排序参数 抽样参数 P29 物种分类 索引格式UDB P31 刻意改变 使用示例 引文 猜你喜欢 写在后面 简介...
扩增子分析流程 —— 数据处理（vsearch）
卢严砖的博客
06-01 9776
在扩增子分析流程中，使用vsearch工具进行前期数据处理的方法
vsearch2.8.1中文帮助文档(免费64位版usearch)
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
08-07 2355
简介USEARCH是最好用的扩增子分析软件，但是代码不开源，可分析大数据的64位版收费，阻止了很多经费有限小伙伴的学习和使用。因此VSEARCH因时而生，免费、开源，让大家分析扩增子即方...
【TDH】Search 安装问题
象在舞的技术专栏
11-20 743
       最近在星环的TDH集群上需要安装一个新的组件——Search，在安装过程中遇到了不少问题，故将主要的问题总结整理如下，以供后续参考~   1、一开始默认安装会出现search server启动不成功、search head启动不成功等问题，也就是默认安装后search无法正常启动。报错如下：主要是/search/data权限问题。   2、需要将安装界面设置的path.d...
2024年最全使用vsearch进行its扩增子高通量序列分析步骤_its扩增子数据库
m0_60567881的博客
05-01 191
注意事项：无论使用编译安装还是使用二进制直接复制运行，都要注意安装对应版本的依赖库，出现报错时参考一下github里安装指定依赖， 高版本的vesearch对应的glibc也较高，可能需要重新编译新版本的zlib之类的库（如有不会调试的，欢迎骚扰！
使用vsearch进行16s扩增子高通量序列分析步骤_vsearch安装(1)
2301_76223624的博客
04-16 568
最近很多小伙伴找我要Linux学习资料，于是我翻箱倒柜，整理了一些优质资源，涵盖视频、电子书、PPT等共享给大家！
【生信】使用VSEARCH处理双端测序数据
小哲的博客
03-01 6700
使用VSEARCH处理双端测序数据 一般情况下，我们从ENA获取的数据为双端测序数据，而且已经去除了引入，那么如何从测序数据获得丰度数据呢？可以使用的软件有VSEARCH、USEARCH以及QIIME等。本文以VSEARCH为例，从输入双端测序序列到最终OTU表的生成。 #!/bin/bash ### 使用VSEARCH处理双端测序数据 ### 目标是得到OTU表和注释信息 ...
使用vsearch进行16s扩增子高通量序列分析步骤
zrc_xiaoguo的博客
10-08 691
VSEARCH是一个开源免费的64位，无内存限制的扩增子数据处理分析软件。（点到为止，其他的建议大家参考原文献和网站)最新文献：Edgar RC (2016)bioRxiv。
elasticsearch下载安装
07-27
要下载和安装Elasticsearch，您可以按照以下步骤进行操作： 1. 首先，将下载的Elasticsearch文件上传到CentOS服务器上。\[1\] 2. 解压缩Elasticsearch文件。您可以使用以下命令：tar -zxvf elasticsearch-6.5.4.tar.gz -C /usr/local/javaSoft/elasticsearch/ 3. 修改Elasticsearch的配置文件。您可以使用以下命令进入配置文件目录：cd /usr/local/javaSoft/elasticsearch/config 然后使用vim编辑器打开elasticsearch.yml文件进行配置。 4. 在浏览器中访问ip:5601/，这将打开Kibana的界面。\[2\] 5. 如果您需要安装ik分词器，可以按照以下步骤进行操作： - 在Windows上解压缩ik分词器文件，并将文件夹名改为ik-analysis。 - 将解压后的整个ik-analysis文件夹放到Elasticsearch安装目录下的plugins文件夹中。 - 使用chown命令将Elasticsearch安装目录的所有权赋予es用户：chown -R es elasticsearch-6.5.4/ 6. 如果需要修改数据和日志存放位置，您可以在elasticsearch.yml文件中进行配置。例如，您可以将数据存放在/usr/local/javaSoft/elasticsearch/data目录下，将日志存放在/usr/local/javaSoft/elasticsearch/logs目录下。\[3\] 请注意，这些步骤是基于CentOS服务器的安装过程。如果您使用的是其他操作系统，请参考相应的安装文档进行操作。 #### 引用[.reference_title] - *1* *2* *3* [ElasticSearch下载、安装、配置详细步骤](https://blog.csdn.net/qq_42238331/article/details/106622232)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]

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