在安装tophat2安装简单但会碰到的问题
- tophat2安装
wget http://ccb.jhu.edu/software/tophat/downloads/tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz - 解压
tar -zxvf tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz - 加入PATH
export PATH=/home/ZQK/tophat-2.1.0.Linux_x86_64/:$PATH - 测试
tophat2
测试出现问题
出现这一问题原因是topcoat更新语法不适用于当前python版本,要做的事吧tophat注释修改一下。
找到你的python2 :whereis python2
选取python2的路径
进入文件夹tophat-2.1.0.Linux_x86_64/ ,vim tophat ,把路径更改,保存即可。