医学影像数据集集锦
前言
本项目的目标是整理一个医学影像方向数据集的列表,提供每个数据集的基本信息,并对其中License允许的提供不限速下载。项目按照数据集关注的器官对其进行分类。需要整理的数据集很多,我们十分期待大佬们为项目作出贡献。
- 如果您发现项目已有的内容中有任何错误(包括但不限于md格式问题,网址失效,数据错误,简介信息补充等),可以通过Pull/Request进行修正。
- 如果您想用的数据集没有出现在列表中,请按照模板提交Issue,并尽量详细地描述数据集信息。我们会尽快添加,若License允许可以免费代下。
当前共收录约 20 个方向的 100+ 个数据集
PS:平时不看CSDN消息,任何问题烦请提个Issue或在我的博客文章下方评论。
转载请联系项目维护者:me@linhan.email
目录
=================
- 肝脏
- 肺
- 胸
- 脑
- 肾脏
- 肠
- 心脏
- 眼睛
- 细胞
- 骨骼
- 前列腺
- 胰腺
- 皮肤
- VQA
- 内窥镜
- 医学影像数据库
- 参考项目/列表
- 贡献者
- Release Note
肝脏
LiTS
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LiTS | 肝脏/肝脏肿瘤 | 分割 | CT | 131+70 | 0/1标签 | nii | CC 4.0 |
![](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/lits.jpg)
LiTS数据集包含131套训练扫描和70组测试数据,其中70组测试数据标签不公开。LiTS训练集中包含3DIRCADB中的所有数据,所以如果合并多个数据集不要合并这两个。Medical Segmentation Decathlon中肝脏分割的数据集就是LiTS。
分割结果可以在线提交进行评估,在线提交方法参考。 在线提交地址
数据集论文:The Liver Tumor Segmentation Benchmark (LiTS)
相关项目: 基于Paddle的肝脏CT影像分割
Sliver07
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Sliver07 | 肝脏 | 分割 | CT | 20+10 | 0/1标签 | MetaImage | Other |
![](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/89371c44fa47f64853ba4168bd262462.png)
这个数据集比较老了,现在用的也比较少,一些研究会将sliver和lits合起来,这样基本上就是所有常用的关于肝脏分割的公开数据了。mhd格式可以用 SimpleITK 读,在medseg项目中有转换成nii的脚本
3D-IRCADB
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3D-IRCADb 01 02 | 肝脏/肝肿瘤 | 分割 | CT | 20+2 | surface mesh | dcm | CC |
![](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/ae74323568b8e8370d9ba70d546d2e39.jpeg)
3D-IRCADb是比较早的一个数据集,有两个子集,分别包含20组和2组CT片子。
CHAOS
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CHAOS | 肝/肾/脾 | 分割 | CT+MRI | 40CT+120MRI | 0/1标签 | dcm | CC 4.0 |
CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-ML21YiIl-1636195013833)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/chaos.png)]
TCGA-LIHC
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
TCGA-LIHC | 肝 | CT/MR/PT | 97患者/237套 | 无标签 | dcm | Other |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-Sr35CLBK-1636195013837)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/tcga-lihc.jpg)]
MSD肝脏血管分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD肝脏血管分割 | 肝脏血管 | 分割 | CT | 443 | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-nNojbcKa-1636195013847)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/Hepatic-Vessels.png)]
肺
MSD肺癌分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD肺癌分割 | 肺脏 | 分割 | CT | 96 | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-yn7hWlPm-1636195013850)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/Lung-Tumours.png)]
LoLa11肺叶分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LoLa11 | None | 分割 | CT | 55 | None | Metaimage | Other |
LoLa11 包含55套CT数据,未发现任何公开标注信息
StructSeg2019
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
StructSeg2019 |
肺部多病智能诊断
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
肺部多病智能诊断 | CT |
CheXpert
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CheXpert | Other |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-duTwLsh1-1636195013855)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/chest-x-pert.png)]
介绍论文: CheXpert: A Large Chest Radiograph Dataset with Uncertainty Labels and Expert Comparison
NIHChest Xray
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NIHChest Xray | 14种肺部疾病/部分病灶位置 | 分类/检测 | CXR | 112,120 | csv | png | CC0: Public Domain |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-yZ51mSFM-1636195013856)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/nih-chest-xray.png)]
介绍论文: ChestX-ray8: Hospital-scale Chest X-ray Database and Benchmarks on Weakly-Supervised Classification and Localization of Common Thorax Diseases
QIN Lung CT
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
QIN Lung CT | 非小細胞癌 | CT | 47 | dcm | Other |
4D-Lung
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4D-Lung | 非小細胞癌 | CT | 20 | dcm | Other |
NSCLC-Radiomics
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
NSCLC-Radiomics | 非小细胞癌 | 分割 | CT | 422 | dcm |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-GcJ6ahL0-1636195013857)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/NSCLC-Radiomics.png)]
vessel12 肺部血管分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
vessel12 肺部血管分割 | 肺部血管 | 分割 | CT | 20 | raw |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-AB33diWL-1636195013858)(https://grand-challenge-public-prod.s3.amazonaws.com/b/1/header.x15.jpeg)]
肺结核
Shenzhen Hospital X-ray Set
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Shenzhen Hospital X-ray Set | 肺结核/正常 | 分类 | CXR | 662 | 类别 | 图片 |
深圳第三医院收集的肺结核胸透数据集,包含326张正常扫描和336张不正常的扫描。
Montgomery County X-ray Set
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Montgomery County X-ray Set | 肺结核/正常 | 分类 | CXR | 138 | 类别 | 图片 |
蒙哥马利市收集的肺结核胸透数据集,包含80张正常的扫描和58张不正常的扫描。
肺炎
Ieee8023
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Ieee8023 | 肺脏 | 分类 | CT | 20 | nii |
持续搜集公开的新冠CT扫描,目前有20个病例。
covid19-ct-scans
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
covid19-ct-scans | 左右肺/新冠感染 | 分割 | CT | 20 | nii |
数据来自Ieee8023,对20组扫描进行了左右肺和感染区的标注。基于这个数据集和另外几个数据集,大佬们做了一个新冠分割的 benchmark
COVID-CT
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
COVID-CT | 分类 | CT | 349 | 图片 |
包含216名新冠患者的349张胸部CT图片,从相关paper中收集。
Figure1-COVID-chestxray-dataset
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Figure1-COVID-chestxray-dataset | 分类 | CXR | 48 | 图片 |
DarwinAI收集的一些新冠CT的图片,是CovidX数据集的一部分。持续更新,使用前可以先pull。
RSNA肺炎检测
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
RSNA肺炎检测 | 之否肺炎/肺炎区域BB | 分类/检测 | CXR | 26684+3000 | 图片 |
RSNA是北美放射学会在Kaggle上组织的一个比赛数据集,数据来自NIH。包含26684张训练数据,有图片的分类和肺炎区域的边界框。
CovidX
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
CovidX | 新冠/其他肺炎/正常 | 分类 | CT | 13569+231 | 图片 |
CovidX数据集是DarwinAI训练CovidNet做的一个数据集,本身没有新的数据,是Ieee8023,Figure1和RSNA组合成的一个数据集。
Flyai Covid
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Flyai Covid |
Flyai举办的一个新冠分类比赛。
covid19-radiography-database
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
covid19-radiography-database | 新冠/其他肺炎/正常 | 分类 | CT | 219+1314+1345 | 图片 |
跟CovidX一样是一个组合数据集,数据来自论文图片和RSNA。
COVID-19-AR
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
COVID-19-AR | dcm |
Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 Positive Population (COVID-19-AR)
CT Images in COVID-19
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
CT Images in COVID-19 | 无标签 | 分类/分割 | CT | 650 | 无 | nii |
肺结节
LIDC-IDRI
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
LIDC-IDRI | 肺部肿瘤 | 目标检测 | CT | 1012 | xls | dcm |
The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive
LUNA16
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
LUNA16 |
天池肺部结节
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
天池肺部结节 | 肺部结节 | 检测 | 低剂量肺部CT | 1000(初赛) + 2000(复赛) | 位置+直径 | mhd | Custom |
LNDB
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
LNDB | 直径大于3mm的肿瘤分割标注/小于3mm肿瘤和非肿瘤标记中心 | 分割/分类 | CT | 294 | XML | MetaImage |
介绍论文: LNDb: A Lung Nodule Database on Computed Tomography
Lung Nodule Malignancy
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Lung Nodule Malignancy | 肺结界良恶性 | 分类 | CT | 4165+2526 | tif |
Data Science Bowl 17
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Data Science Bowl 17 |
Lung-PET-CT-Dx
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Lung-PET-CT-Dx | 肺癌 | 目标检测 | CT | 363 | xml | dcm |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-tRU10Ywx-1636195013860)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/Lung-PET-CT-Dx.png)]
气胸
SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation |
胸
CBIS-DDSM
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
CBIS-DDSM | 正常/良性/恶性 | 分类 | CT | 2620 |
介绍论文: Deep Learning to Improve Breast Cancer Early Detection on Screening Mammography A curated mammography data set for use in computer-aided detection and diagnosis research
QIN Breast
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
QIN Breast 0102 | MRI | 67 |
Rider Breast MRI
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Rider Breast MRI | MRI |
ACRIN 6688
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
ACRIN 6688 | CT | 83 |
BraTS2013
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
BraTS2013 |
BraTS2015
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
BraTS2015 |
BraTS2021
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
BraTS2015 |
脑
MSD脑瘤分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD Brain Tumor Segmentation | 胶质瘤/肿瘤/水肿 | 分割 | MRI | 484 Train + 266 Test | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
MSD海马体分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD Hippocampus Segmentation | 海马体 | 分割 | MRI | 394 | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-d4tph43w-1636195013862)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/msd-hippocampus.png)]
Iseg2019
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Iseg2019 |
ABIDE
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
ABIDE | 是否有自闭症 | 分类 | MRI | 539+573 |
自闭症患者的头部MRI扫描,包含539例自闭症患者和573个正常扫描对照组。 介绍论文: The autism brain imaging data exchange: towards a large-scale evaluation of the intrinsic brain architecture in autism.
ADNI
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
ADNI |
介绍论文: Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI)
CQ500
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CQ500 | 分割 | CT | 491组扫描 | by-nc-sa 4.0 |
脑出血
RSNA Intracranial Hemorrhage Detection
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
RSNA Intracranial Hemorrhage Detection | CT |
肾脏
Kits19
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Kits19 | 肾脏/肾肿瘤 | 分割 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-AE35434R-1636195013863)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/kits19.png)]
肠
CT COLONOGRAPHY
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
CT COLONOGRAPHY | CT |
包含没有结肠息肉,有6-9mm息肉和大于10mm息肉的数据。
MSD肠道分割数据集
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD肠道分割数据集 | 结肠癌原发病灶 | 分割 | CT | 126训练+64测试 | CC-BY-SA 4.0 |
心脏
EchoNet
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
EchoNet | 心脏 | 分割 | MRI | 10300 | 0/1 |
介绍论文: EchoNet-Dynamic: a Large New Cardiac Motion Video Data Resource for Medical Machine Learning
MMWHS
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
MMWHS | 心脏 | 分割 | CT / MRI | 20CT、20MRI | 类别 | nii |
mmwhs是心脏分割数据集,共有8类,MRI和CT两种模态 相关项目: Hybrid Loss Guided Convolutional Networks for Whole Heart Parsing
MSD心脏分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD心脏分割 | 左心房 | 分割 | MRI | 20(训练)+10(测试) | CC-BY-SA 4.0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-dV0EDM1c-1636195013864)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/mds-cardiac.png)]
主动脉
冠状动脉分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Automated Segmentation of Coronary Arteries | 冠状动脉 | 分割 | CTA | 40+20 | Custom |
眼睛
DRIVE
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
DRIVE | 眼底血管 | 分割 | 眼底照片 | 40 | 0/1 | 图片 |
DRIVE数据集是一个糖尿病病人眼底血管分割数据集。
ODIR-5k
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
ODIR-5k | 正常和7种疾病 | 分类 | 眼底彩色照片 | 5000 | 图片 |
ODIR-5K包括5000名患者的年龄,双眼的彩色眼底照片和医生的诊断关键词。该数据集是上工医疗技术有限公司从中国不同医院/医疗中心收集的“真实”患者信息。在这些机构中,眼底图像由市场上的各种相机捕获,例如Canon,Zeiss和Kowa,因此导致各种各样的图像分辨率。病人的识别信息会被移除。注释由经过培训的人类读者进行标记,并具有质量控制管理。患者分为8个标签,包括正常(N),糖尿病(D),青光眼(G),白内障(C),AMD(A),高血压(H),近视(M)和其他疾病/异常(O)。
FIRE 视网膜图像数据
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
FIRE 视网膜图像数据 | 分类 | 视网膜图像 | 129 |
FIRE 是一个视网膜眼底图像数据集,包含 129张 眼底视网膜图像,由不同特征组合成 134对 图像组合。这些图像组合根据特质被划分为3类。眼底图像由 Nidek AFC-210 眼底照相机采集,分辨率为2912x2912,视觉仰角为40度。图像由 Papageorgiou Hospital 医院和Aristotle University of Thessaloniki大学共同构建,由于Thessaloniki 大学采集自39名患者。. 数据包括以下几部分内容: 1.成对的视网膜图像。 2.彩色ROI掩模(作为二值图像)。 3.特征ROI掩模(作为二值图像)。 4.每个图像对应的标注点。
STARE
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
STARE | 眼底血管 | 分割 | 眼底照片 | 400 | 照片 | 照片 | 无 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-3emF09zR-1636195013865)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/stare.png)]
STructured Analysis of the Retina数据集包含400张眼底照片,作者团队对这些数据进行了多种诊断,并对部分数据的血管进行了标注
CHASE_DB1
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CHASE_DB1 | 眼底血管 | 分割 | 眼底照片 | 28 | png | png | 无 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-rnj8gUF3-1636195013868)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/CHASE_DB1.png)]
Kinston大学公开的一个小规模眼底分割数据集,包含28张眼底照片及对应的分割标签。
IDRiD
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
IDRiD | 常见DR病灶、视盘、DR病变等级等 | 分类、检测、分割 | 眼底照片 | * | tif/csv | jpg | CC BY 4.0 |
Indian Diabetic Retinopathy Image Dataset (IDRiD)
前列腺
PANDA
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
PANDA | 前列腺癌分级 | 镜检图片 | 10616张镜检 | 分类 | tiff |
MSD前列腺分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD前列腺分割 | 前列腺中央腺体及外周区域 | 分割 | 多模态核磁 | 32(训练)+16(测试) | CC-BY-SA 4.0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-Ms3lKxSd-1636195013869)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/msd-prostate.png)]
QIN-PROSTATE-Repeatability
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
QIN-PROSTATE-Repeatability | 前列腺癌 | MRI | 15 | dcm |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-RgLpxujA-1636195013869)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/QIN-Prostate-Repeatability.png)]
胰腺
MSD胰腺分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MSD胰腺分割 | 胰腺肿瘤 | 分割 | CT | 282(训练)+139(验证) | 0/1 | nii | CC-BY-SA 4.0 |
PDMR-833975-119-R
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
PDMR-833975-119-R | 胰腺癌 | MRI | 20 | dcm |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-SK6zWGbV-1636195013871)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/PDMR-833975-119-R.png)]
皮肤
SIIM-ISIC Melanoma Classification
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
SIIM-ISIC Melanoma Classification | 皮肤癌病变类别 | 分类 | 皮肤镜 | 88.3K张图片 | 类别 | dicom |
目前最大的皮肤镜图像集合,用来在皮肤病变图像中之别黑色素瘤,图片以DICOM格式提供,同时包含图像元数据,有的图像也以JPEG和TFRecord格式提供,TFRecords格式的图像已被调整为统一的1024x1024
细胞
Data Science Bowl 18
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
Data Science Bowl 18 | 细胞核 | 分割 | 841张/37333个细胞核 | 0/1 | 图片 |
细胞核分割数据集
介绍论文: Nucleus segmentation across imaging experiments: the 2018 Data Science Bowl
血细胞涂片分类
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
血细胞涂片分类 | 四种血细胞类型 | 分类 | 镜检 | 12500 | - | 图片 |
血细胞分类数据集包含12500张四种血细胞的照片。图片是从大的血细胞涂片照片上截下来的,数据集经过增广。图片都很小,训练时注意IO瓶颈。
ISBI细胞跟踪
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
ISBI细胞跟踪 | 细胞像素级别位置 | 跟踪 | 镜检 | 图片 |
在镜检视频中像素级跟踪细胞位置
Aistudio下载 2D+Time Datasets
骨骼
MURA-1.1
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
MURA-1.1 | 正常/非正常 | 分类 | x-ray | 40561 |
介绍论文: MURA: Large Dataset for Abnormality Detection in Musculoskeletal Radiographs
RSNA Bone Age
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
RSNA Bone Age |
磁共振图像脊柱结构多类别三维自动分割
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
磁共振图像脊柱结构多类别三维自动分割 | 椎骨和椎间盘 | 分割 | MRI T2WI | 172 | 0/1 | nii | Custom |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-3pZkdKbs-1636195013872)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/spine-mri.png)]
膝盖
MRNet
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
MRNet |
脊椎
Verse大规模脊椎分割数据集
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
VerSe | 脊椎 | 分割 | CC BY-SA 4.0 |
![](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/231e23ac90cc2abff08b37d668057876.png)
VQA
PathVQA
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
---|---|---|---|---|---|---|
PathVQA | 图片 | 4998图片/32799问答 | 图片 |
介绍论文: PathVQA: 30000+ Questions for Medical Visual Question Answering
内窥镜
SARAS-MESAD
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
SARAS-MESAD | 24种动作 | 静态背景动作识别 | 内窥镜 | 4(真实手术)+5(模拟手术) | CC BY-NC-SA 4.0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-7YA4mKXc-1636195013873)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/saras-mesad.png)]
SARAS-MESAD
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
SARAS-ESAD | 21种手术动作 | 静态背景动作识别 | 内窥镜 | 22,601(训练)+4,574(测试) | 图片 | BB | CC BY-NC-SA |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-fo2gnOEU-1636195013874)(https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/SARAS-ESAD.png)]
数字病理
CAMELYON
名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CAMELYON16,17 | 镜检 | 图片 | BB | CC0 |
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-ZZtyJzLP-1636195013875)(https://grand-challenge-public-prod.s3.amazonaws.com/b/80/camelyon17_header.x15.jpeg)]
交流群
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医学影像数据库
TCIA:The Cancer Imaging Archive
MedPix 包含超过12000名患者和59000张影像
Belarus tuberculosis portal 包含结核病人的CT,胸透和检验数据
LONI 神经相关医学影像
参考项目/列表
Open-Access Medical Image Repositories
Medical Image Datasets Download Links
Dermatology Image Classification
贡献者
(按照首次贡献时间排序)
多语言代码生成器 Mail : linhandev@qq.com
Release Note
2021/5/21
开始添加数据集图片,接受多次外部贡献,对存量数据集进行合规检查,数据集总量达到71
2020/11/20
添加Issue模板,鼓励外部贡献,数据集数量达到67
2020/11/8
在Github发布,整理格式,添加多个数据集
2020/6/11
添加LIDC-IDIR,编写数据压缩脚本
2020/6/4
添加MMWHS心脏分割数据集,SIIM皮肤病分类比赛数据集
2020/5/27
添加ISBI细胞分割,TCGA-LIHC肝脏,4D-Lung肺部数据集,围绕乳腺癌添加一系列数据集
2020/5/20
项目添加数据集计数和release note,数据集方面添加 RSNA骨龄,PathVQA,FIRE视网膜,DDSM乳腺癌等数据集
2020/5/13
项目在Aistudio公开,包含约40个数据集