神经元结构及评价标准

SWC——重建结果

   “神经突起追踪的最终输出结果是基于ASCII编码的文本数据。标准文件格式为Southampton Neurosciences Set开发的SWC文件。其由如下几个组成部分构成：节点的编号id，表示节点在当前文件中的顺序位置；节点的类型Type，表示节点归属的神经突起追踪信号类型，常用的有2表示轴突，3表示树突，5表示分叉点，6表示端点等等；节点坐标x；节点坐标y；节点坐标z；节点半径R；节点的父节点id，表示当前节点的上一个节点的id，是体现节点逻辑顺序的最重要的属性。”
                     ————摘自: 宋思远. 多神经元突起追踪方法研究[D]. 华中科技大学, 2018.

    关于SWC的介绍可参考：https://blog.csdn.net/jujiyu6446/article/details/100138564

重建结果评价指标

1.SD

    空间距离平均值 （SD ）表示 神经元骨架提取结果中的所有节点与 “黄金标准 ”中神经元骨架的空间距离的平均值。

2.SSD

    大尺度空间距离 （SSD ）计算的是神经元骨架提取结果中所有大尺度节点与“黄金标准 ”中的神经元骨架空间距离的平均值。
    当神经元骨架提取结果上的节点与“黄金标准 ”中神经元骨架上的所有节点的最小距离大于两个像素时，就将神经元骨结果上的这个节点定义为大尺度节点。

                    ————摘自：刘克然.基于局部半径估算的神经元结构重建算法的研究与实现[D].湖南:湖南大学,2018.