利用浅层和端到端深层神经网络实现心肌梗死的自动检测和定位

Automating detection and localization of myocardial infarction using shallow and end-to-end deep neural networks
原文地址:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1568494620303239
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Accepted 2 May 2020
摘要:
心梗检测和定位可以帮助医生更好的进行诊断;
这篇文章主要的工作在于,提出了两种心梗检测和定位的方法:
a.离散小波变换(DWT)+主成分分析(PCA)+浅层神经网络(NN)
b.端到端的卷积神经网络(CNN)
心梗检测:相当于是二分类任务(即心梗或健康);
心梗定位:相当于多分类任务(就是将心梗大类继续细分为六种子类);
效果:
NN方法存在2%的误报,但是需要的计算资源少;
CNN方法不存在误报,但是需要的计算资源多;

两种方法流程图
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进一步展开介绍:
数据预处理部分
ECG信号主要的伪影有两个:
1).高频噪声:包括肌电图(EMG)诱发的噪声、电极上的机械力和电源线干扰;
2).基线漂移:包括患者移动和呼吸,以及ECG记录期间仪器的不稳定;
处理方法:
使用带宽为5Hz的60Hz带阻滤波器,去除电力线干扰及其谐波;
然后再使用3次样条插值(CSI)去拟合原信号的低频趋势(基线),再使用原信号减去该拟合的基线,从而消除基线漂移;
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NN方法:
首先是DWT和PCA方法:
离散小波变换(DWT)作用在于对原型号进行特征提取;
主成分分析(PCA)作用在于进行特征降维;
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然后是浅层神经网络(NN):
作者在原文中并没有明确的说明NN是一个怎样的网络结构,但是根据其描述,笔者猜测这可能就是一个三层的MLP;
端到端的CNN方法:
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首先描述这个端到端的CNN的网络架构;
1).原信号经过降噪(上面已经提到);
2).使用一维卷积获取ECG信号(时间序列)的特征,并将其填充为一个多个通道的二维矩阵(类似图像信号);
3).再使用ResNet对图像信号进行分类;
实验部分:
PTB数据集划分:
在这项研究中,数据被分割成12个导联信号的5秒长样本,构建了5968个标记有六个不同类别的片段。为了平衡数据分布并保持先验概率相等,信号窗口使用具有可调重叠百分比的重采样,如表2所示。请注意,该数据完全不可识别且可公开获取;因此,本次调查未获得任何伦理声明。(这里其实重采样率其实很高,因此模型的性能有被高估的风险!)
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获取的数据ECG信号片段(5s/段)被分为3组,60%作为训练集,10%作为验证集,其余作为测试集;
实验结果:
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参考文献:
K. Jafarian, V. Vahdat, S. Salehi, and M. Mobin, “Automating detection and localization of myocardial infarction using shallow and end-to-end deep neural networks,” Applied Soft Computing, vol. 93, p. 106383, Aug. 2020.

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