miRNA target预测软件 miRanda v3.3a最新安装地址

最新推荐文章于 2024-08-27 10:40:52 发布
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玉米基因miRNA结合位点预测工具
沉香best的博客
02-09 1903
打开官网后，如下所示：psRNATarget是一个在线工具，用于预测植物小RNA和宿主基因的互作关系。它基于植物小RNA和宿主基因的序列数据，使用一个准确的算法进行分析和预测。用户可以输入小RNA和宿主基因的序列，或者直接上传相应的FASTA文件。该页面会显示预测结果，包括小RNA的靶向位点，以及宿主基因的功能注释和调控网络。用户还可以进行进一步分析，例如查看小RNA和宿主基因的共表达网络，以及预测小RNA的调控效应。
miRanda安装、编译和环境变量配置
weixin_43960055的博客
03-21 3244
miRanda安装、编译和环境变量配置 HOME=/home/Biochem，即服务器的根目录。 一、下载 工作路径：$HOME/software $ wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz 二、安装 $ tar zxvf miRanda-aug2010.tar.gz $ mv miRanda-3.3a miRanda $ ./configure --prefix=$HOME/software/miRanda –p
miranda
05-09
miranda,QQ和MSN集成工具
miRanda安装与使用
最新发布
henlenya的博客
08-27 1356
miRanda安装与使用。进行 miRNA 和 mRNA /lncRNA/circRNA之间的相互作用预测
miRanda 安装
cugandrew的博客
04-28 1072
Windows 安装 miRanda
miRanda-通过circRNA的sequence来预测靶向的miRNA
niutingbaby的博客
08-24 3432
miRanda-通过circRNA的sequence来预测靶向的miRNA
输入序列就可以预测 - 在线版miRanda靶基因预测来了
热门推荐
微生信
06-11 1万+
miRNA靶基因预测是研究miRNA经常要进行的操作，经典的miRNA靶基因预测软件有miRanda，targetscan等。targetscan有在线版本，而miRanda一直没有在线版本，并且网站（http://www.microRNA.org）还经常挂，为此，我们微生信平台推出了在线版的miRanda。 地址：http://www.bioinformatics.com.cn/local_miranda_miRNA_target_prediction_120tp://www.http://www.bi
动物miRNA靶基因本地预测（一）—— 软件安装
weixin_43566022的博客
04-25 5422
miRNA的研究大多离不开靶基因的预测，这能帮助我们快速的获得潜在的靶基因，缩小试验验证的基因范围。本文将介绍4种动物miRNA的本地化预测软件的安装方法。
miranda工具的使用（对UPNP设备渗透测试）
05-20
本文是利用miranda工具对upnp设备进行一系列渗透测试……
EPLMI-master.zip_EPLMI_lncRNA_lncRNA-miRNA_预测
07-15
EPLMI（Enhanced Predictive Model for LncRNA-miRNA Interactions）是一种先进的预测工具，其主要目标是揭示lncRNA与miRNA之间的潜在关联关系。通过EPLMI-master.zip这个压缩包，我们可以深入理解这种复杂分子网络...
circrna:circRNA定量，差异表达分析和miRNA靶标预测RNA-Seq数据
03-11
nf-core / circrna是一种生物信息学流水线，用于定量，miRNA靶标预测和RNA测序数据中存在的circRNA的差异表达分析（当前支持总RNA-Seq配对末端测序数据，已映射至智人Gencode参考基因组GRCh37， GRCh38 v34）。...
p-TAREF:植物miRNA靶标预测工具-开源
04-28
p-TAREF代表工厂TARget REFiner。 它基于多个特征信息识别植物microRNA靶标。 了解更多http://www.biomedcentral.com/1471-2164/12/636查询，评论等，请给我们任何一个人发邮件@ ashwanijha.bioinfo@gmail.com或...
成熟的miRNA预测软件microtar-0.9.6发布
在miRNA靶基因预测研究的实践中，研究人员通常会结合实验验证的方式来确认软件预测结果的准确性。常用的实验方法包括双荧光素酶报告基因实验、Western blot、qRT-PCR等，它们可以在细胞或动物模型中验证特定miRNA对...
如何下载使用miranda
Frankooool的博客
02-02 1830
Miranda wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz tar zxvf miRanda-aug2010.tar.gz cd miRanda-3.3a/ ./configure make install 最好在linux环境下安装 miranda 的input文件为fasta file miranda 1.fasta 2.fasta -out results.txt grep '>>' results &
miRanda和mirSVR:预测miRNA结合位点的工具
庐州月光的博客
12-14 2909
欢迎关注”生信修炼手册”!预测miRNA结合位点的工具很多，以TargetScan为代表的工具，利用结合位点的保守性进行预测，对于大部分保守的结合位点而言其准确性较好，然而还是有部分mi...
miRNA测序数据生信分析——第四讲，未知物种的生信分析实例
weixin_44616693的博客
10-13 1879
以上就是针对未知物种的miRNA分析。与已知物种的分析之间存在重叠，重点是两个预测软件miRanda和TargetScan的使用。上面步骤中涉及了很多脚本，但都是很简单的文件内容提取比对。
miRNA生物信息数据分析流程初探(二)
Wang____Yang的博客
11-11 1291
在我们描述了miRNA的基本分析流程，本文中我们将对miRNA分析流程中每一个步骤的输出文件进行解释。
linux分析mirna,利用miRanda軟體分析miRNA targets
weixin_39554021的博客
05-14 855
如果我們有一條序列，想知道上面有沒有miRNA targets，有什麼工具可以幫我們完成呢?今天就來介紹一個歷史悠久，預測miRNA targets的好工具-miRanda。miRanda的演算法發表自2003年，也是全世界第一個發表miRNA target的預測軟體，跟其他相似的分析工具(如TargetScan, PicTar)比起來，miRanda不但提供了搜尋網頁(http://www.mi...
kali下的miranda工具只适合同一路由下使用
weixin_30642561的博客
07-16 443
在终端输入如下命令： miranda -v -i eth0 上面的命令是指定打开网卡eth0，返回结果如下： miranda提示输入开启upnp的主机，现在我们不知道哪台主机开启了upnp，输入命令“msearch”，会自动搜索upnp主机， 接着我们会看到扫描到的upnp主机： 按 CTRL +C终止扫描，输入host list。 可以看到搜集的主机列...
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