miRanda安装、编译和环境变量配置

miRanda安装、编译和环境变量配置

HOME=/home/Biochem，即服务器的根目录。

一、下载
工作路径：$HOME/software

$ wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz

二、安装

$ tar zxvf miRanda-aug2010.tar.gz
$ mv miRanda-3.3a  miRanda
$ ./configure --prefix=$HOME/software/miRanda

–prefix是配置选项,执行成功后再编译 (make)、安装(make install)。

–prefix参数含义是，有关内容将自动保存在目录$HOME/software/miRanda下，生成bin目录存放可执行文件，生成share目录存放其他资源文件，生成lib目录存放库文件（而此安装不生成lib目录）。该软件任何的文档都被复制到$HOME/software/miRanda目录下，也方便了以后的维护。

假如不指定prefix参数，可执行文件默认放在/usr/local/bin，库文件默认放在/usr/local/lib，配置文件默认放在/usr/local/etc。其它的资源文件放在/usr /local/share。指定了prefix参数，以后若不需要，直接删掉该文件夹就好了。

遇到的坑是：就是没有带上–prefix=参数，编译不成功，不能创建相关文件夹，也就不能安装相关运行文件。

$ make
$ make install

三、建立软链接，运行程序加入到配置环境变量

$ ln -s  $HOME/software/miRanda/bin/miranda  $HOME/anaconda3/bin/miranda
$ miranda -h  

帮助文档显示，配置成功。