使用 scikit-image 进行图像处理

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划痕试验时间序列分析。

图像处理在当今非常适用,对于2019冠状病毒疾病,无论是开发治疗方法还是寻找检测病毒的新方法,都给全球的研究人员带来了新的挑战。为了对 2019冠状病毒进行研究,研究人员通常需要对图像进行大量计算,以检测有助于得出新见解和结论的特定元素。

在这篇文章中,我将介绍图像处理的基础知识和一个小教程,详细介绍如何将图像处理用于阈值和分割,这是图像处理中两种非常强大的技术。在文章中,我们将使用 scikit-image,因此可能需要 Python 的基本背景知识和一些高等数学知识才能完全理解该概念。

什么是 scikit-image?

scikit-image 是一个专门用于图像处理的 Python 库,它可以与 Scipy 库和其他可能有助于计算的 Python 库一起使用,为了充分使用 scikit-image,用户还必须使用 Matplotlib 来显示转换后的图像并进行图像分析。在本教程中,我们将使用 scikit-image 库、Matplotlib 和 NumPy 中的特定函数来对划痕检测进行分析。

什么是划痕检测?

除非我们有丰富的生物学经验,否则大多数人可能不知道什么是划痕试验,我将简要概述什么是划痕检测,然后直接进入教程。

划痕试验是生物学家用来跟踪细胞运动和相互作用的一种技术,具体来说,生物学家在培养皿中采集细胞样本,并在细胞平面上制造人工伤口,在开发人造伤口后,生物学家会定期拍摄任何细胞运动的图像,以开发出一系列用于分析的图像。

在下面的教程中,我们将处理下面提供的图像,因此在开始之前下载此图像并将其添加到我们的项目目录中。

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