import scanpy as sc
annData = sc.read_h5ad(filePath)
print(annData.to_df()) #这里显示的就是单细胞数据的pandas.DataFrame类型了
#其中annData.var里面的是细胞,annData.var里面的是基因
使用python包scanpy读取单细胞h5ad文件
于 2022-02-12 17:08:20 首次发布
import scanpy as sc
annData = sc.read_h5ad(filePath)
print(annData.to_df()) #这里显示的就是单细胞数据的pandas.DataFrame类型了
#其中annData.var里面的是细胞,annData.var里面的是基因