# 导入所需的包和库
library(Seurat)
library(anndata)
library(reticulate)
use_python("你的python路径")
ad <- import("anndata")
# 读取数据集
final_ad <- ad$read_h5ad("xxxxxx.h5ad")
# 设置变量名
colnames(final_ad$X) <- final_ad$var$features
# 创建 Seurat 对象
seurat_obj <- Seurat::CreateSeuratObject(counts = final_ad$X, assay = "RNA",
meta.data = final_ad$obs)
R seurat读入h5ad文件
于 2024-01-19 11:24:41 首次发布