R: 边界显示问题——ylim() xlim()

在R中绘制图形时，有时候会遇到图1所示情况，上边界为显示完全，是因为边界在坐标轴范围之外，所以未显示出来。

图1 上边界不显示的PCA图形

解决办法：
由图1可知，下边界显示正常，并且负向y轴的距离也合适，所以在利用ylim()设定坐标轴范围时，负轴设为“NA”，正轴最大值为15，则设为15。将下述代码加到原代码中再次运行，结果如图2，正常。

ylim = c(NA, 15)

图2 利用ylim()调节后的图形

注：当标签名称过长而与边界重叠时，也可通过调节坐标轴范围解决。

关于其他坐标轴调整及转换方式还包括：

• expand_limits()
• scale_x_continuous() 和scale_y_continuous()
• scale_x_log10(), scale_y_log10() : for log10 transformatio
• scale_x_sqrt(), scale_y_sqrt() : for sqrt transformation
• scale_x_reverse(), scale_y_reverse() : to reverse coordinates
• coord_trans(x =“log10”, y=“log10”) : possible values for x and y are “log2”, “log10”, “sqrt”, …
• scale_x_continuous(trans=‘log2’), scale_y_continuous(trans=‘log2’) : another allowed value for the argument trans is ‘log10’
  具体内容可参考：【r<-ggplot2】修改x和y轴刻度