Biosynthetic potential of the global ocean microbiome

全球海洋微生物组的生物合成潜力

原文：Biosynthetic potential of the global ocean microbiome
网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9259500/
发表：2022 年 6 月 22 日
翻译：雪垆，2022-08-29
参考：
http://www.benagen.com/html/shichangyuzhichi/wenxianjiedu/596.html
https://www.codetd.com/article/14335976

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Abstract

天然微生物群落在系统发育和代谢上是多样化的。除了未充分探索的生物群外，这种多样性还包括对生态和生物技术相关的酶和生化化合物的丰富发现潜力。然而，研究这种多样性以确定合成此类化合物的基因组途径并将其分配给各自的宿主仍然具有挑战性。由于在全球范围内分析基因组解析数据的局限性，公海中微生物的生物合成潜力在很大程度上仍然未知。在这里，我们通过整合来自培养和单细胞的大约 10,000 个微生物基因组与来自 1,000 多个海水样本的 25,000 多个新重建的基因组草图，研究了海洋中生物合成基因簇的多样性和新颖性。这些努力揭示了大约 40,000 个推定的主要是新的生物合成基因簇，其中一些是在以前未曾怀疑的系统发育组中发现的。在这些群体中，我们确定了一个富含生物合成基因簇的谱系（’ CandidatusEudoremicrobiaceae’）属于未培养的细菌门，包括该环境中一些生物合成最多样化的微生物。根据这些，我们表征了磷酸肽素和蟒酰胺途径，分别揭示了不寻常的生物活性化合物结构和酶学的案例。总之，本研究证明了微生物学驱动的策略如何能够在未充分探索的微生物群和环境中对先前未描述的酶和天然产物进行研究。由此，我们确定了phospeptin 和 pythonamide 途径的特征， 分别揭示了生物活性化合物结构和酶学异常的病例。

Subject terms： 计算生物学和生物信息学，环境微生物学