LAMMPS实例教程—In文件详解

本教程详细解析LAMMPS的In文件,涵盖建模、力学、传热、相变、界面、吸附、流动、物性等10大专题,提供实例代码和后处理方法。通过实例讲解纳米压痕、热导率计算、结冰成核、润湿行为、吸附行为等,适合分子动力学初学者和进阶者学习。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

LAMMPS实例教程—In文件详解

说明:
本博文主要介绍专栏 《 L A M M P S 实例教程— I n 文件详解》 \rm 《LAMMPS实例教程—In文件详解》 LAMMPS实例教程—In文件详解》, 针对于 L a m m p s \rm Lammps Lammps 可分析的物理过程进行讲解,提供In文件以及后处理方法,持续更新。
目前分为 10 个专题: \rm \color{Violet} 目前分为10个专题: 目前分为10个专题: 1)力学专题、2)传热专题、3)相变专题、4)界面专题、5)吸附专题、6)流动专题、7)物性专题、8)基础理论专题、9)机器学习专题、10)反应力场专题。

注意!!! \color{red} 注意!!! 注意!!!
博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改! 博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改! 博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改!

感谢 ♡ \heartsuit D r . X i a n \rm \color{Violet} Dr.Xian Dr.Xian, D r . B I N B O \rm \color{Violet} Dr.BINBO Dr.BINBO, D r . F a i r y \rm \color{Violet} Dr.Fairy Dr.Fairy D r . M a p l e \rm \color{Violet} Dr.Maple Dr.Maple , D r . 一语撼星辰 \rm \color{Violet} Dr.一语撼星辰 Dr.一语撼星辰 ♡ \heartsuit 对专栏的贡献。
欢迎大家积极投稿,博主团队提供后处理帮助。 \color{red}欢迎大家积极投稿,博主团队提供后处理帮助。 欢迎大家积极投稿,博主团队提供后处理帮助。
投稿邮箱: l a m m p s _ m a t e r i a l s @ 163. c o m \rm \color{red}投稿邮箱:lammps\_materials@163.com 投稿邮箱:lammps_materials@163.com


关注 M r . m a t e r i a l   , \color{Violet} \rm Mr.material\ , Mr.material , 更 \color{red}{更} 多 \color{blue}{多} 精 \color{orange}{精} 彩 \color{green}{彩}


主要专栏内容包括:
  †《LAMMPS小技巧》: ‾ \textbf{ \underline{\dag《LAMMPS小技巧》:}}  LAMMPS小技巧》: 主要介绍采用分子动力学( L a m m p s Lammps Lammps)模拟相关安装教程、原理以及模拟小技巧(难度: ★ \bigstar
  ††《LAMMPS实例教程—In文件详解》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag《LAMMPS实例教程—In文件详解》:}}  ††LAMMPS实例教程—In文件详解》: 主要介绍采用分子动力学( L a m m p s Lammps Lammps)模拟相关物理过程模拟。(包含:热导率计算、定压比热容计算,难度: ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar
  †††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:}}  †††Lammps编程技巧及后处理程序技巧》: 主要介绍针对分子模拟的动力学过程(轨迹文件)进行后相关的处理分析(需要一定编程能力。难度: ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar )。
  ††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag《分子动力学后处理集成函数—Matlab》:}}  ††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》: 主要介绍针对后处理过程中指定函数,进行包装,方便使用者直接调用(需要一定编程能力,难度: ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar )。
  †††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:}}  †††††SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》: 主要介绍针对处理后的数据可视化,并提供对应的绘图模板(需要一定编程能力,难度: ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar ★ \bigstar )。
  ††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag\dag《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:}}  ††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》: 主要采用 O v i t o \rm Ovito Ovito软件,对 L a m m p s \rm Lammps Lammps 生成的轨迹文件进行渲染(难度: ★ \bigstar ★ \bigstar )。

  专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文): ‾ \color{red}{\textbf{ \underline{专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):}}}  专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):
注意: \color{red} 注意: 注意:如需只订阅某个单独博文,请联系博主邮箱咨询。 l a m m p s _ m a t e r i a l s @ 163. c o m \rm lammps\_materials@163.com lammps_materials@163.com

♠ \spadesuit † \dag 开源后处理集成程序:请关注专栏《LAMMPS后处理——MATLAB子函数合集整理》
♠ \spadesuit † \dag † \dag 需要付费定制后处理程序请邮件联系: l a m m p s _ m a t e r i a l s @ 163. c o m \rm lammps\_materials@163.com lammps_materials@163.com

建模篇:分子动力学模型快速构建 \rm 建模篇:分子动力学模型快速构建 建模篇:分子动力学模型快速构建

M a t e r i a l   S t u d i o + M o l t e m p l a t e + P a c k m o l \rm \color{red} Material\ Studio+Moltemplate+Packmol Material Studio+Moltemplate+Packmol

1、 建模篇(上):OPLSAA力场参数之快速建模—MS+Moltemplate

2 、建模篇(下):力场快速设置-AuToFF+Moltemplate


♠ \spadesuit ♠ \spadesuit L a m m p s Lammps Lammps 后处理及编程技巧第一次线上分享论坛( 2021.11.20 2021.11.20 2021.11.20):
视频链接 \color{red}{视频链接} 视频链接(请点击)
资料下载 \color{red}{资料下载} 资料下载 (请点击)
提取码: o a x k 提取码:\color{red}{oaxk} 提取码:oaxk

欢迎关注公众号 : 分子模拟  M D   C l u b   ( M r _ M a t e r i a l s ) \rm \color{red} 欢迎关注公众号:分子模拟\ MD\ Club\ (Mr\_Materials) 欢迎关注公众号:分子模拟 MD Club (Mr_Materials)

如果有疑问的订阅粉丝,请加入后处理答疑群(群号: 167548520 ) ‾ \color{red} \underline {如果有疑问的订阅粉丝,请加入后处理答疑群(群号:167548520)} 如果有疑问的订阅粉丝,请加入后处理答疑群(群号:167548520


关注 M r . m a t e r i a l   , \color{Violet} \rm Mr.material\ , Mr.material , 更 \color{red}{更} 多 \color{blue}{多} 精 \color{orange}{精} 彩 \color{green}{彩}

请添加图片描述


文章目录

1. 力学专题 1. 力学专题 1.力学专题

1. Lammps之纳米压痕(包含in文件)

(请点击跳转)更新于2022-01-13,该博文由 D r . B I N B O \rm Dr.BINBO Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

请添加图片描述
请添加图片描述

2. 石墨烯复合材料单轴压缩-应力应变曲线以及弹性模量计算(包含in文件)

(请点击跳转)更新于2022-03-16,该博文由 D r . B I N B O \rm Dr.BINBO Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

3. Lammps剪切作用的两种实现方法及对比—Deform以及Velocity

(请点击跳转)更新于2022-03-20,该博文由 D r . B I N B O \rm Dr.BINBO Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

4. 有趣的纳米“通道”—Lammps实现循环不同压痕深度

(请点击跳转)更新于2022-03-27,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

5. Lammps切削过程实现以及工件表面识别(包含in文件)

(请点击跳转)更新于2022-05-01,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

6. Lammps模拟剪切作用下的位错滑移

(请点击跳转)更新于2022-10-11,该博由 Binbo 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

2. 传热专题 2. 传热专题 2.传热专题

1. LAMMPS非平衡分子动力学 (NEMD) 纳米线热导率教程—一个代码循环计算不同温度和尺寸

(请点击跳转)更新于2021-10-28,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


在这里插入图片描述

2. 漫谈分子动力学计算热导率的五种方法

(请点击跳转)更新于2022-04-14,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


在这里插入图片描述
请添加图片描述

3. 相变专题 3. 相变专题 3.相变专题

1. Lammps实现结冰匀相成核

(请点击跳转)更新于2022-04-21,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

2. Lammps实现Ar的沸腾过程(包含in文件)

(请点击跳转)更新于2022-04-27,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

3. Lammps实现随机粗糙度表面的沸腾现象

(请点击跳转)更新于2022-05-08,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

4. Ar在三维粗糙结构表面的沸腾过程

(请点击跳转)更新于2023-01-08,该博由 Dr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

5. Lammps实现定向结冰成核通道

(请点击跳转)更新于2022-12-01,该博由 Dr.Fairy 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

4. 界面专题 4. 界面专题 4.界面专题

1. Lammps不同亲疏水性粗糙表面的润湿行为模拟(包含in文件)

(请点击跳转)更新于2021-10-28,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

2. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(一)

(请点击跳转)更新于2022-05-04,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

3. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(规则粗糙表面)(二)

(请点击跳转)更新于2022-05-15,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

4. 一个代码循环计算水在石墨烯表面的接触角

(请点击跳转)更新于2023-03-17,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


在这里插入图片描述

5. 纳米颗粒包覆结构的模型构建技巧

(请点击跳转)更新于2023-05-17,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


在这里插入图片描述

5. 吸附专题 5. 吸附专题 5.吸附专题

1. L a m m p s 实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为 \sout{1. Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为} 1.Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为

(暂不开源) \color{red}(暂不开源) (暂不开源)

(请点击跳转)更新于2022-03-29,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

2. Lammps实现甲烷与水的竞争吸附

(请点击跳转)更新于2022-03-29,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


在这里插入图片描述

请添加图片描述

3. 巨正则蒙特卡洛—甲烷和二氧化碳的竞争吸附GCMC

(请点击跳转)更新于2022-04-2,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

4. Lammps压力控制之活塞控压—一个代码循环限域空间内的气体分子数

(请点击跳转)更新于2022-03-11,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

5. 多孔氧化硅结构模型构建-复现(Journal of Physical Chemistry B)

(请点击跳转)更新于2023-05-12,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

6. 流动专题 6. 流动专题 6.流动专题

1. 不同速度、不同压力环境中的液滴对撞—一个代码循环速度和压力(氮气分子数)

(请点击跳转)更新于2022-01-30,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

2. Lammps实现纳米孔道内的气体流动(未完成)

(请点击跳转)更新于2022-09-01,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

3. Lammps实现纳米孔道内瓦斯驱替过程(包含In文件)

(请点击跳转)更新于2022-11-12,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

7. 物性专题 7. 物性专题 7.物性专题

1. Lammps之循环定压比热熔计算

(请点击跳转)更新于2021-11-10,该博文由 D r . X i a n \rm Dr.Xian Dr.Xian 提供( V i c t o r _ X i a n 285 @ 163. c o m \rm Victor\_Xian285@163.com Victor_Xian285@163.com)。


在这里插入图片描述

2. Lammps之MP方法粘度计算(包含in文件)

(请点击跳转)更新于2022-01-10,该博文由 D r . X i a n \rm Dr.Xian Dr.Xian 提供(Victor_Xian285@163.com)。


在这里插入图片描述在这里插入图片描述

8. 基本理论专题 8. 基本理论专题 8.基本理论专题

1. 基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动

(请点击跳转)更新于2022-03-11,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述
在这里插入图片描述

2. 聊聊有趣的布朗运动

(请点击跳转)更新于2022-04-25,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

3. 学习麦克斯韦-玻尔兹曼分布速度分布

(请点击跳转)更新于2022-05-04,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。


请添加图片描述

9. 机器学习专题 9. 机器学习专题 9.机器学习专题

(请点击跳转)更新于2022-12-03,该博由 Mr.Maple 提供(lammps_materials@163.com)。


1. 基于GPUMD的NEP机器学习势函数—二氧化硅融化

在这里插入图片描述

10. 反应力场专题 10. 反应力场专题 10.反应力场专题

Continue…

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

Mr. Material

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值