LAMMPS实例教程—In文件详解
说明:
本博文主要介绍专栏
《
L
A
M
M
P
S
实例教程—
I
n
文件详解》
\rm 《LAMMPS实例教程—In文件详解》
《LAMMPS实例教程—In文件详解》, 针对于
L
a
m
m
p
s
\rm Lammps
Lammps 可分析的物理过程进行讲解,提供In文件以及后处理方法,持续更新。
目前分为
10
个专题:
\rm \color{Violet} 目前分为10个专题:
目前分为10个专题: 1)力学专题、2)传热专题、3)相变专题、4)界面专题、5)吸附专题、6)流动专题、7)物性专题、8)基础理论专题、9)机器学习专题、10)反应力场专题。
注意!!!
\color{red} 注意!!!
注意!!!
博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改!
博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改!
博客相关案例代码仅作为参考,如有不合理的地方请根据需求修改!
感谢
♡
\heartsuit
♡
D
r
.
X
i
a
n
\rm \color{Violet} Dr.Xian
Dr.Xian,
D
r
.
B
I
N
B
O
\rm \color{Violet} Dr.BINBO
Dr.BINBO,
D
r
.
F
a
i
r
y
\rm \color{Violet} Dr.Fairy
Dr.Fairy
D
r
.
M
a
p
l
e
\rm \color{Violet} Dr.Maple
Dr.Maple ,
D
r
.
一语撼星辰
\rm \color{Violet} Dr.一语撼星辰
Dr.一语撼星辰
♡
\heartsuit
♡ 对专栏的贡献。
欢迎大家积极投稿,博主团队提供后处理帮助。
\color{red}欢迎大家积极投稿,博主团队提供后处理帮助。
欢迎大家积极投稿,博主团队提供后处理帮助。
投稿邮箱:
l
a
m
m
p
s
_
m
a
t
e
r
i
a
l
s
@
163.
c
o
m
\rm \color{red}投稿邮箱:lammps\_materials@163.com
投稿邮箱:lammps_materials@163.com
关注 M r . m a t e r i a l , \color{Violet} \rm Mr.material\ , Mr.material , 更 \color{red}{更} 更 多 \color{blue}{多} 多 精 \color{orange}{精} 精 彩 \color{green}{彩} 彩!
主要专栏内容包括:
†《LAMMPS小技巧》:
‾
\textbf{ \underline{\dag《LAMMPS小技巧》:}}
†《LAMMPS小技巧》: 主要介绍采用分子动力学(
L
a
m
m
p
s
Lammps
Lammps)模拟相关安装教程、原理以及模拟小技巧(难度:
★
\bigstar
★)
††《LAMMPS实例教程—In文件详解》:
‾
\textbf{ \underline{\dag\dag《LAMMPS实例教程—In文件详解》:}}
††《LAMMPS实例教程—In文件详解》: 主要介绍采用分子动力学(
L
a
m
m
p
s
Lammps
Lammps)模拟相关物理过程模拟。(包含:热导率计算、定压比热容计算,难度:
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★)
†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:
‾
\textbf{ \underline{\dag\dag\dag《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:}}
†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》: 主要介绍针对分子模拟的动力学过程(轨迹文件)进行后相关的处理分析(需要一定编程能力。难度:
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★)。
††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》:
‾
\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag《分子动力学后处理集成函数—Matlab》:}}
††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》: 主要介绍针对后处理过程中指定函数,进行包装,方便使用者直接调用(需要一定编程能力,难度:
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★)。
†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:
‾
\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:}}
†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》: 主要介绍针对处理后的数据可视化,并提供对应的绘图模板(需要一定编程能力,难度:
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★)。
††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:
‾
\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag\dag《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:}}
††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》: 主要采用
O
v
i
t
o
\rm Ovito
Ovito软件,对
L
a
m
m
p
s
\rm Lammps
Lammps 生成的轨迹文件进行渲染(难度:
★
\bigstar
★
★
\bigstar
★)。
专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):
‾
\color{red}{\textbf{ \underline{专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):}}}
专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):
注意:
\color{red} 注意:
注意:如需只订阅某个单独博文,请联系博主邮箱咨询。
l
a
m
m
p
s
_
m
a
t
e
r
i
a
l
s
@
163.
c
o
m
\rm lammps\_materials@163.com
lammps_materials@163.com
♠
\spadesuit
♠
†
\dag
† 开源后处理集成程序:请关注专栏《LAMMPS后处理——MATLAB子函数合集整理》
♠
\spadesuit
♠
†
\dag
†
†
\dag
† 需要付费定制后处理程序请邮件联系:
l
a
m
m
p
s
_
m
a
t
e
r
i
a
l
s
@
163.
c
o
m
\rm lammps\_materials@163.com
lammps_materials@163.com
建模篇:分子动力学模型快速构建 \rm 建模篇:分子动力学模型快速构建 建模篇:分子动力学模型快速构建
M a t e r i a l S t u d i o + M o l t e m p l a t e + P a c k m o l \rm \color{red} Material\ Studio+Moltemplate+Packmol Material Studio+Moltemplate+Packmol
1、 建模篇(上):OPLSAA力场参数之快速建模—MS+Moltemplate
2 、建模篇(下):力场快速设置-AuToFF+Moltemplate
♠
\spadesuit
♠
♠
\spadesuit
♠
L
a
m
m
p
s
Lammps
Lammps 后处理及编程技巧第一次线上分享论坛(
2021.11.20
2021.11.20
2021.11.20):
视频链接
\color{red}{视频链接}
视频链接(请点击)
资料下载
\color{red}{资料下载}
资料下载 (请点击)
提取码:
o
a
x
k
提取码:\color{red}{oaxk}
提取码:oaxk
欢迎关注公众号 : 分子模拟 M D C l u b ( M r _ M a t e r i a l s ) \rm \color{red} 欢迎关注公众号:分子模拟\ MD\ Club\ (Mr\_Materials) 欢迎关注公众号:分子模拟 MD Club (Mr_Materials)
如果有疑问的订阅粉丝,请加入后处理答疑群(群号: 167548520 ) ‾ \color{red} \underline {如果有疑问的订阅粉丝,请加入后处理答疑群(群号:167548520)} 如果有疑问的订阅粉丝,请加入后处理答疑群(群号:167548520)
关注 M r . m a t e r i a l , \color{Violet} \rm Mr.material\ , Mr.material , 更 \color{red}{更} 更 多 \color{blue}{多} 多 精 \color{orange}{精} 精 彩 \color{green}{彩} 彩!
文章目录
- LAMMPS实例教程—In文件详解
- 建模篇:分子动力学模型快速构建 \rm 建模篇:分子动力学模型快速构建 建模篇:分子动力学模型快速构建
- 1. 力学专题 1. 力学专题 1.力学专题
- 2. 传热专题 2. 传热专题 2.传热专题
- 3. 相变专题 3. 相变专题 3.相变专题
- 4. 界面专题 4. 界面专题 4.界面专题
- 5. 吸附专题 5. 吸附专题 5.吸附专题
- 6. 流动专题 6. 流动专题 6.流动专题
- 7. 物性专题 7. 物性专题 7.物性专题
- 8. 基本理论专题 8. 基本理论专题 8.基本理论专题
- 9. 机器学习专题 9. 机器学习专题 9.机器学习专题
- 10. 反应力场专题 10. 反应力场专题 10.反应力场专题
- Continue...
1. 力学专题 1. 力学专题 1.力学专题
1. Lammps之纳米压痕(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-01-13,该博文由 D r . B I N B O \rm Dr.BINBO Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。
2. 石墨烯复合材料单轴压缩-应力应变曲线以及弹性模量计算(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-03-16,该博文由 D r . B I N B O \rm Dr.BINBO Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。
3. Lammps剪切作用的两种实现方法及对比—Deform以及Velocity
(请点击跳转)更新于2022-03-20,该博文由 D r . B I N B O \rm Dr.BINBO Dr.BINBO 提供。(Email:lammps_materials@163.com)。
4. 有趣的纳米“通道”—Lammps实现循环不同压痕深度
(请点击跳转)更新于2022-03-27,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. Lammps切削过程实现以及工件表面识别(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-05-01,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
6. Lammps模拟剪切作用下的位错滑移
(请点击跳转)更新于2022-10-11,该博由 Binbo 提供(lammps_materials@163.com)。
2. 传热专题 2. 传热专题 2.传热专题
1. LAMMPS非平衡分子动力学 (NEMD) 纳米线热导率教程—一个代码循环计算不同温度和尺寸
(请点击跳转)更新于2021-10-28,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. 漫谈分子动力学计算热导率的五种方法
(请点击跳转)更新于2022-04-14,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. 相变专题 3. 相变专题 3.相变专题
1. Lammps实现结冰匀相成核
(请点击跳转)更新于2022-04-21,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现Ar的沸腾过程(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-04-27,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. Lammps实现随机粗糙度表面的沸腾现象
(请点击跳转)更新于2022-05-08,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
4. Ar在三维粗糙结构表面的沸腾过程
(请点击跳转)更新于2023-01-08,该博由 Dr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. Lammps实现定向结冰成核通道
(请点击跳转)更新于2022-12-01,该博由 Dr.Fairy 提供(lammps_materials@163.com)。
4. 界面专题 4. 界面专题 4.界面专题
1. Lammps不同亲疏水性粗糙表面的润湿行为模拟(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2021-10-28,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(一)
(请点击跳转)更新于2022-05-04,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. Lammps实现液滴撞击疏水石墨烯表面(规则粗糙表面)(二)
(请点击跳转)更新于2022-05-15,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
4. 一个代码循环计算水在石墨烯表面的接触角
(请点击跳转)更新于2023-03-17,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. 纳米颗粒包覆结构的模型构建技巧
(请点击跳转)更新于2023-05-17,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. 吸附专题 5. 吸附专题 5.吸附专题
1. L a m m p s 实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为 \sout{1. Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为} 1.Lammps实现水分子在纳米颗粒球表面的吸附行为
(暂不开源)
\color{red}(暂不开源)
(暂不开源)
(请点击跳转)更新于2022-03-29,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现甲烷与水的竞争吸附
(请点击跳转)更新于2022-03-29,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. 巨正则蒙特卡洛—甲烷和二氧化碳的竞争吸附GCMC
(请点击跳转)更新于2022-04-2,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
4. Lammps压力控制之活塞控压—一个代码循环限域空间内的气体分子数
(请点击跳转)更新于2022-03-11,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
5. 多孔氧化硅结构模型构建-复现(Journal of Physical Chemistry B)
(请点击跳转)更新于2023-05-12,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
6. 流动专题 6. 流动专题 6.流动专题
1. 不同速度、不同压力环境中的液滴对撞—一个代码循环速度和压力(氮气分子数)
(请点击跳转)更新于2022-01-30,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. Lammps实现纳米孔道内的气体流动(未完成)
(请点击跳转)更新于2022-09-01,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. Lammps实现纳米孔道内瓦斯驱替过程(包含In文件)
(请点击跳转)更新于2022-11-12,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
7. 物性专题 7. 物性专题 7.物性专题
1. Lammps之循环定压比热熔计算
(请点击跳转)更新于2021-11-10,该博文由 D r . X i a n \rm Dr.Xian Dr.Xian 提供( V i c t o r _ X i a n 285 @ 163. c o m \rm Victor\_Xian285@163.com Victor_Xian285@163.com)。
2. Lammps之MP方法粘度计算(包含in文件)
(请点击跳转)更新于2022-01-10,该博文由 D r . X i a n \rm Dr.Xian Dr.Xian 提供(Victor_Xian285@163.com)。
8. 基本理论专题 8. 基本理论专题 8.基本理论专题
1. 基于MATLAB的分子动力学自编程序—300K下Ar的分子运动
(请点击跳转)更新于2022-03-11,该博文由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
2. 聊聊有趣的布朗运动
(请点击跳转)更新于2022-04-25,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
3. 学习麦克斯韦-玻尔兹曼分布速度分布
(请点击跳转)更新于2022-05-04,该博由 Mr.Material 提供(lammps_materials@163.com)。
9. 机器学习专题 9. 机器学习专题 9.机器学习专题
(请点击跳转)更新于2022-12-03,该博由 Mr.Maple 提供(lammps_materials@163.com)。