病理组学领域常用的32个公开数据集汇总|个人观点·24-11-12

小罗碎碎念

这一期推文旨在解决一个大家普遍关系的问题:病理AI领域目前有哪些公开数据集?

无论是初学者还是已经有一定项目经验的老师,在开始一个项目之前,估计都会想一想,目前自己的研究领域有哪些公开的数据集。

为了减少大家的工作量,我打算定期整理目前已有的病理组学、影像组学以及基因组学相关的数据,这一期先分享病理组学相关的数据集

推文中只提供文字版的整理结果,完整版的Excel表格请移步知识星球获取。

持续更新中


一、乳腺癌

数据集
BACH
BRACS
PCam
ACROBAT
DROID-Breast
CAMELYON16

二、泛癌

数据集
CPTAC
MIDOG
PLCO
TCGA

三、肺腺癌

数据集
WSSS4LUAD
DHMC LUAD

四、结直肠癌

数据集
HunCRC-2
TCGA CRC-MSI
PAIP2020
HunCRC

五、前列腺癌

数据集
AGGC
PANDA
DiagSet
SICAP

六、卵巢癌

数据集
UBCOCEAN
TOC

七、其余类型

数据集链接类型
EBRAINS……脑肿瘤
GTEx……尸检组织
SegPath……细胞/组织分割
MHIST……结肠息肉
TCGA TIL……TIL分类
BCC……基底细胞癌
BCNB……早期乳腺癌淋巴结转移预测
TissueNet……宫颈上皮病变
RCC-DHMC……肾癌亚型分类
CRC100k……结直肠腺癌

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