小罗碎碎念
这一期推文旨在解决一个大家普遍关系的问题:病理AI领域目前有哪些公开数据集?
无论是初学者还是已经有一定项目经验的老师,在开始一个项目之前,估计都会想一想,目前自己的研究领域有哪些公开的数据集。
为了减少大家的工作量,我打算定期整理目前已有的病理组学、影像组学以及基因组学相关的数据,这一期先分享病理组学相关的数据集。
推文中只提供文字版的整理结果,完整版的Excel表格请移步知识星球获取。
一、乳腺癌
数据集 |
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BACH |
BRACS |
PCam |
ACROBAT |
DROID-Breast |
CAMELYON16 |
二、泛癌
数据集 |
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CPTAC |
MIDOG |
PLCO |
TCGA |
三、肺腺癌
数据集 |
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WSSS4LUAD |
DHMC LUAD |
四、结直肠癌
数据集 |
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HunCRC-2 |
TCGA CRC-MSI |
PAIP2020 |
HunCRC |
五、前列腺癌
数据集 |
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AGGC |
PANDA |
DiagSet |
SICAP |
六、卵巢癌
数据集 |
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UBCOCEAN |
TOC |
七、其余类型
数据集 | 链接 | 类型 |
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EBRAINS | …… | 脑肿瘤 |
GTEx | …… | 尸检组织 |
SegPath | …… | 细胞/组织分割 |
MHIST | …… | 结肠息肉 |
TCGA TIL | …… | TIL分类 |
BCC | …… | 基底细胞癌 |
BCNB | …… | 早期乳腺癌淋巴结转移预测 |
TissueNet | …… | 宫颈上皮病变 |
RCC-DHMC | …… | 肾癌亚型分类 |
CRC100k | …… | 结直肠腺癌 |