"本文介绍了如何利用awk工具在Linux环境中筛选文件内容。通过awk命令，我们可以提取特定列并根据条件过滤数据。例如，从.gtf文件中提取出第一、四、五、十列，要求第三列值为'transcript'，可以使用如下命令：`catFemale.merge.gtf | awk '$3 == "transcript" {printf $1 " " $4 " " $5 " " $10 "
"}
awk是Linux自带的文件内容筛选工具，awk可以对文件内容进行切片输出，提取出我们想要的内容。
awk使用格式：awk [option] ‘条件{print ${num}}’ 。
现在我想将上图所示的.gtf文件中的第一、四、五、十列提出出来，要求第三列的值必须为“transcript”，可以通过awk命令实现。
cat Female.merge.gtf | awk '$3=="transcript"{printf $1 "\t" $4 "\t" $5 "\t" $10"\n" }'> Tden_female.bed
结果如图所示
2669
294
被折叠的 条评论
为什么被折叠?
到【灌水乐园】发言
扫一扫
