1 染色体定位分析概念
染色体定位分析是将基因家族成员在染色体上的位置标注出来,观察基因家族成员在染色体上是否成簇分布。
2 分析工具
2.1 MG2C(MapGene2Chromosome)
MG2C是在线分析工具,网址如下:
http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/
2.1.1 输入文件
在页面上方有两个对话框,左边填入4列以制表符分隔的矩阵,从左到右,以此为:GeneID、起始位置、终止位置和染色体号,这些数据可由组装到染色体水平的注释文件得到。
2.1.2 输出结果
点击DRAW按钮,就可绘图,生成图片可以导出为.svg格式,后续再利用Ai进行修改。
2.1.3 参数修改
绘制的图片中,染色体id的字体、字号等细节通过页面左方的选项框进行修改。
2.2 TBtools
TBtools是功能强大的图形化操作的基于Windows、Mac操作系统开发的生信分析软件,下方是文献引用的GB/T 7714格式。
Chen C, Chen H, Zhang Y, et al. TBtools: an integrative toolkit developed for interactive analyses of big biological data[J]. Molecular plant, 2020, 13(8): 1194-1