cibersortx怎么用_【搬砖】免疫浸润 实践

最新推荐文章于 2024-07-03 07:57:33 发布
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版权
本文介绍了如何使用CIBERSORTx进行免疫浸润分析，从上传数据到解决遇到的问题，再到使用R进行更详细的可视化和统计分析，包括调整箱线图以显示细胞类型与样本类型的差异。
摘要由CSDN通过智能技术生成

牛转乾坤！新年快乐，小白来啃生信发paper~

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上传文件要求

ok，来整理我的mixture。

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准备好了~22880genes*10samples

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cibersortx计算细胞组分

我的数据是microarray，所以最后那个箭头不勾选。

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结果

数据可下载txt/csv/..，图片是截图的。。没找到下载的地方。

————————————————————————————————————

可见网页上的输出比较局限，没有好看的图，分组数据比较等功能也没有，所以接下来用R来实现cibersortx。

参考2：https://cloud.tencent.com/d

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敬普
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