在RStudio里面部署Python

2022.8.30 星期二

在过一天就正式步入研三了，感觉一只脚已经踏出了学校，瞬间感觉之前荒废了好多时间，现在最后不到一年的时间更要一天当两天过了，抓着尾巴，再多学一点是一点，今天早上一下地就是一早上，中午再睡个午觉，迷迷糊糊一会就三点多了，真的时间过的超级快，感觉我就看了会学习资料就快11点了，还想着去跑跑步，仿佛时间有点不允许，生信一个小时的课被我反复看，加操作确实需要大量时间，唉，时间都去哪了，有的时候会迷茫，但是不应该一直迷茫，走出来继续奔跑，那才是你应该实施的与信仰的！

今日份代码

今天对shell语法没怎么看，主要是在想之前内容，前面好多有点忘记，导致后面的内容看起来有点吃力。
今天尝试着把Python还有linux与R全部实现在RStudio上面来操作，结果发现R版本过高。。。。又得想办法。大体思路如下：
1.在R里面直接下载reticulate包来做桥接。

install.packares("reticulate")
reticulate::py_config() #调用函数查看Python安装路径

使用usethis包来配置路径

install.packages("usethis")
usethis::edit_r_environ()

加入你自己Python的安装路径

RETICULATE_PYTHIN = "你的Python安装路径"

注意分割符，不要写成转译符。配置好后就可以直接在RStudio里面使用Python啦。

reticulate::repl_python()

这样做生物信息的三个语言就可以融合在一个解释器里面啦！