Linux下安装R包fgsea报错及解决办法

上面是官方提供的安装方法，但是我按照这个方法安装时报错

所以选择手动安装

手动安装按照帖子

生信小猪，公众号：生信小猪手动安装R包

手动安装时也报错，报了下面错误

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :

  无法载入共享目标对象‘/home/software/R-4.2.2/lib64/R/library/Matrix/libs/Matrix.so’：:

  libRblas.so: 无法打开共享对象文件: 没有那个文件或目录

Calls: <Anonymous> ... asNamespace -> loadNamespace -> library.dynam -> dyn.load

停止执行

ERROR: lazy loading failed for package ‘fgsea’

* removing ‘/home/daichunyan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/fgsea’

经过寻找我发现我的libRblas.so这个文件在/home/software/R-4.2.2/lib64/R/lib文件夹下，于是我把它加在我的环境变量中。

把下面这句话加在~/.bashrc文件中，如果是自己的话，根据libRblas.so文件所在路径进行相应修改

export LD_LIBRARY_PATH=/home/software/R-4.2.2/lib64/R/lib:$LD_LIBRARY_PATH

随后

安装这个包时费了一些时间，这里选择记录一下，希望能供后来者借鉴。