单细胞findmarkers鉴定出每个基因的logFC,相应重排序,GSEA是个富集好选择。
参考:
个人觉得无论bulk还是sc,对全gene matrix依据logFC排序再做GSEA是比较合适的,提取出差异基因对markers做GSEA个人感觉是原理上的错误。
单细胞findmarkers鉴定出每个基因的logFC,相应重排序,GSEA是个富集好选择。
参考:
个人觉得无论bulk还是sc,对全gene matrix依据logFC排序再做GSEA是比较合适的,提取出差异基因对markers做GSEA个人感觉是原理上的错误。