解决从github上安装CellChat失败的问题

最近需要分析单细胞数据的细胞通讯，准备安装CellChat，期间遇到各种报错，查了很多的资料才得到解决，现记录下来，免得后期重蹈覆辙。

R版本是4.1.2。

首先安装依赖的包：

install.packages(c('NMF','circlize'))
BiocManager::install("ComplexHeatmap")

接着安装cellchat

devtools::install_github("sqjin/CellChat")

报错1：

解决方法：

去github上把此包下载到本地尝试安装。下载链接：https://codeload.github.com/sqjin/CellChat/zip/refs/heads/master

本地安装：

# 包的路径
devtools::install_local("C:/Downloads/CellChat-master/CellChat-master.zip")

接着遇到报错2：

F:\rtools43\x86_64-w64-mingw32.static.posix\bin\nm.exe: CellChat_Rcpp.o: file format not recognized
F:\rtools43\x86_64-w64-mingw32.static.posix\bin\nm.exe: RcppExports.o: file format not recognized

解决办法：

把下载到本地的CellChat-master.zip，解压缩，删除其中src文件夹中的两个*.o和一个*.so文件删除，重新压缩。本地安装重新压缩的CellChat-master.zip。

写在最后：

我在网盘上保存了修改后的CellChat包，你也可以直接下载安装。
链接:https://pan.baidu.com/s/16CVzpYeHM3VvLxoHInMfCg 
提取码:4vza

参考链接：

Install Package fail on windows. (file format not recognized) · Issue #5 · sqjin/CellChat (github.com)

R本地安装Github包（CellChat） – 何柏晓的个人网站 (hbox.cool)