cellchat安装

研究猿lxy

已于 2024-01-17 16:41:27 修改

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分类专栏：细胞通讯文章标签：细胞通讯 r语言

于 2024-01-16 13:34:46 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_65188455/article/details/135274799

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官方安装文档：

GitHub - jinworks/CellChat: R toolkit for inference, visualization and analysis of cell-cell communication from single-cell and spatially resolved transcriptomics

我安装过的命令：

install.packages("devtools")
install.packages('NMF')
devtools::install_github("jokergoo/circlize")
devtools::install_github("jokergoo/ComplexHeatmap")
devtools::install_github("immunogenomics/presto")
BiocManager::install("BiocNeighbors")
devtools::install_github("jinworks/CellChat")

参考的链接：（很详细）

CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com)