CIRCOS教程翻译 2.10——anlge offset and orientation

终于到这一章的最后一节了，还是基础讲解。角度偏差在circos的设置以地球方向为例：北-90，南90，东0，西180，当然几乎所有的定位默认是-90。举个例子来说，之前我们写的所有程序几乎都是从chr1开始，有没有发现chr1的开始位置就是-90呢？所以想要从哪个方向开始，就在<image>里面重写吧。

其次我们之前的程序都是顺时针clockwise，当然还有逆时针的countclockwise，主配置文件如下：

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>>

<<include ideogram.conf>>
<<include ticks.conf>>

<image>
<<include etc/image.conf>>
angle_orientation* = counterclockwise #重写圈圈定位方向
</image>

karyotype   = data/karyotype/karyotype.human.txt

chromosomes_units           = 1000000
chromosomes_display_default = no
chromosomes                 = hs1;hs2;hs3;hs4;hs5

 
chromosomes_reverse = hs2;hs3 #反转这两个的方向，圈圈主方向是逆时针的，那么这两个的方向是顺时针的

<highlights>
<highlight>
file = data/3/chr.highlights.txt #格式如下所示
r0   = 0.925r
r1   = 0.95r
</highlight>
</highlights>

<<include etc/housekeeping.conf>>

hs1 0 247249719 fill_color=chr1
hs2 0 242951149 fill_color=chr2
hs3 0 199501827 fill_color=chr3
hs4 0 191273063 fill_color=chr4
hs5 0 180857866 fill_color=chr5