iTOL简介
大家在看高分文章时,总会惊叹于,为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树,而且好看的图也能直接提升文章的档次,冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔,而你每次花了半个月时间做的进化树不是被老板嫌弃配色丑,就是太单调,没有各种辅助的注释信息。然后你默默捧起别人的文章学习时发现他们绝大部分都是用iTOL这个在线工具来进行的系统发育树的美化的。
之前看有好几个公众号的几篇文章推送了教大家怎么使用iTOL这个网站:http://itol.embl.de/
例如:
宏基因组:教你用iTOL轻松绘制高颜值系统进化树
生信生信:微生物多样性研究之物种聚类树美化工具—iTOL
生信小王子:使用iTOL美化进化树
iTOL的基本使用流程:
搜索itol后进入如下界面,点右上角Login进入系统
新用户需要邮箱注册,老用户直接登录
点击进入My Tree,点击Upload tree files 或者直接把树文件拖入框中
点击树名称进入树的编辑界面,左上角依次是放大,缩小,还原当前窗口,树的信息以及搜索。右上角是Controls界面
Basic界面可以设计树的形式,枝长,单击分支可编辑颜色,线条样式,序列名称,在Tree str