Kraken2+Bracken（Kraken2联合Bracken宏基因组物种注释）

1. 简介

Kraken2是一个基于k-mer算法的高精度宏基因组序列分类软件，能够快速的将测序reads进行物种分类。

Kraken2官网

Bracken (Bayesian Reestimation of Abundance with KrakEN)是一种高精度统计方法，结合Kraken可以实现高准确度的宏基因组测序数据物种分类分析。

Bracken官网

Kraken和Bracken的更多介绍可以参考：宏基因组序列物种分类之kraken 1/2和Bracken的使用

2. 软件安装和数据库下载

Kraken2安装

# 源码安装
git clone https://github.com/DerrickWood/kraken2.git
cd kraken2
sh install_kraken2.sh  ~/bin/kraken2  # 安装路径（编译后文件存储文件夹）
~/bin/kraken2/kraken2 --help  #可加入到环境变量，方便使用

# conda安装（推荐，可以帮忙解决很多依赖）
conda install -y kraken2
kraken2 --help

Bracken安装

# 源码安装ÿ