protein.seq

最新推荐文章于 2024-11-14 18:01:28 发布
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文章标签： 矩阵 线性代数
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male.tra.seq
SUMPLUSS的博客
07-24 690
Protein:
ChIP-seq
Al_Liz_Well
07-05 1347
ChIP-seq
本地BLAST的使用
duanhebo的博客
03-27 1万+
本地BLAST的使用 数据库的获取 最简单的方法是直接到NCBI或别的网站去下载 也可以将自己的序列，或与自己工作相关的序列进行整理构建成一个小型的数据库 注意：以上文件格式一般可存为fasta格式 构建BLAST用的数据库 将已构建好的数据拷贝到你所设定的数据库所在文件夹 运行cmd命令 在cmd环境中输入如下所示命令 formatdb –i inseqs.fa –p F –o T –n db_...
序列和序列对象
wangprince2017
12-09 1562
序列和序列对象 Seq 类 Seq类是Biopython最基础的一类, 储存序列信息. from Bio.Seq import Seq. 该类基本格式是Seq(self, data, alphabet=Alphabet()). 类似于字符串, 能够储存蛋白, DNA, RNA序列信息. 该类是不可变的. 该类和str类似, 支持count, find, split, strip. 相比str...
RNA-seq【分析记录】
GeekFocus
08-27 2087
视频学习笔记 概述 预处理 FASTQC数据质控 数据过滤Trimmomatic 有参转录组序列比对 不同比对软件的比较 常用序列比对算法 基因组比对 STAR hisat2 转录本比对 RSEM 无参转录组 转录本从头拼接原理 拼接方法 Trinity 表达定量 RNA-seq常用统计定量单位 基因组比对 Htseq-Count FeatureCount 转录本比对 RSEM 数据分析 思路？ 差异表达 + Deseq标准化原理 富集分析 + GO + 通路富集分
RNA-Seq名词解释
热门推荐
生物医学信息学博客
11-14 1万+
RNA-Seq名词解释 1.index 测序的标签，用于测定混合样本，通过每个样本添加的不同标签进行数据区分，鉴别测序样品。 2.碱基质量值 （Quality Score或Q-score）是碱基识别（Base Calling）出错的概率的整数映射。碱基质量值越高表明碱基识别越可靠，碱基测错的可能性越小。 3.Q30 碱基质量值为Q30代表碱基的精确度在99.
Signac包-1.Analyzing PBMC scATAC-seq
组学之心，专注多组学/ 医学AI 领域
07-31 1285
好的，开始学习scATAC-seq的数据是怎么玩的了，先跑完Signac的教程，边跑边思考怎么跟自己的课题相结合。
chip-seq全流程
2302_80012625的博客
09-12 1192
以上内容涵盖了从 GTF 文件处理、检测基因的可变剪切、提取最长转录本，到测序数据的过滤和质控、比对到参考基因组、处理 BAM 文件，以及最终的可视化操作。这些步骤帮助你一步步优化数据质量，为下游分析奠定坚实基础。如有进一步的学习内容或问题，欢迎继续分享。
python给定dna等分成两个序列_Biopython序列
weixin_35073008的博客
01-14 623
Biopython序列是指一系列字母，用于表示生物体的蛋白质，DNA或RNA。它由Seq类表示。Seq类在Bio.Seq模块中定义。下面来看看如何在Biopython中创建一个简单的序列，如下所示：>>> from Bio.Seq import Seq>>> seq = Seq("AGCT")>>> seqSeq('AGCT')>>...
PyPI 官网下载 | rcsb.utils.seq-0.49.tar.gz
01-29
这个文件名揭示了该库的核心模块——rcsb.utils.seq，这通常意味着它包含了一系列与序列操作相关的工具和函数，可能是针对生物信息学领域，特别是蛋白质结构数据库（RCSB Protein Data Bank）的序列处理。...
PyPI 官网下载 | rcsb.utils.seq-0.23.tar.gz
01-15
"rcsb"通常代表蛋白质数据银行（Research Collaboratory for Structural Bioinformatics Protein Data Bank），这是一个全球性的蛋白质结构数据库。"utils"可能表示该库包含了一些实用工具或模块，而"seq"很可能指的...
二维差分矩阵 模板题
bitkingtrue的博客
11-11 350
输入一个 n 行 m 列的整数矩阵，再输入 q 个操作，每个操作包含五个整数 x1,y1,x2,y2,c ，其中 (x1,y1) 和 (x2,y2) 表示一个子矩阵的左上角坐标和右下角坐标。每个操作都要将选中的子矩阵中的每个元素的值加上 c 。请你将进行完所有操作后的矩阵输出。输入格式 第一行包含整数 n,m,q 。接下来 n 行，每行包含 m 个整数，表示整数矩阵。接下来 q 行，每行包含 5 个整数 x1,y1,x2,y2,c ，表示一个操作。输出格式 共 n 行，每行 m 个整数，表示所有操作进行完毕
图形几何之美系列：仿射变换矩阵之Y-Up和Z-Up
哈市雪花的博客
11-11 385
所有的3D工具都包含一个具有X、Y和Z轴的三维环境。在这些工具中，X轴方向是相同的，即在前视图是从左到右的水平线。然而, 不同的 3D 工具可能对Y轴和Z轴的朝向有不同的解释。一些3D工具是Y-Up的, 即Y轴是竖直方向的；而其他的3D工具是Z-Up的, 即Z轴是竖直方向的。
【C语言】计算3x3矩阵每行的最大值并存入第四列
她是不会无条件的！！
11-14 222
我们定义了一个3行4列的二维数组。
数据结构与算法：二分搜索/二分查找的python实现与相关力扣题35.搜索插入位置、74.搜索二维矩阵
shanshan的博客
11-11 695
输入：matrix = [[1,3,5,7],[10,11,16,20],[23,30,34,60]], target = 13。输入：matrix = [[1,3,5,7],[10,11,16,20],[23,30,34,60]], target = 3。否则，返回 false。输入: nums = [-1,0,3,5,9,12], target = 9。输入: nums = [-1,0,3,5,9,12], target = 2。输入: nums = [1,3,5,6], target = 5。
矩阵中的路径（dfs)-acwing
2401_87338545的博客
11-10 355
【代码】矩阵中的路径（dfs)-acwing。
图形几何之美系列：仿射变换矩阵之先转后偏
哈市雪花的博客
11-11 1032
如果一次仿射变换中存在多种类型的姿态变换，需要先进行矩阵左上角的3X3部分（缩放、旋转、镜像、非均匀变换）的构造处理，最后再叠加偏移。这是我们从一些书籍或老司机口中得知的重要经验，大白话就是“先转后偏”，那么为什么要这样呢？先偏后转不行吗？还是先转后偏有其不可忽略的独门绝技？如果先偏移，则需要基于偏移值的坐标点进行矩阵左上角3X3部分的构造，这将变得复杂的多，这对于大多数人来说不可接受，毕竟我们很多时候要做的是化繁为简，同时提高精度。下面我们对比下先转后偏和先偏后转的特点和区别。
glsl中vec4是行矩阵还是列矩阵
以爱护甲,爱满枫林。
11-11 454
默认情况下：在GLSL中，vec4通常被视为列向量。矩阵向量乘法表示矩阵左乘列向量。向量矩阵乘法表示行向量右乘矩阵。
矩阵的对角化&特征值分解
最新发布
u013600306的博客
11-14 450
矩阵对角化和特征值分解实际上描述的是同一个过程的不同方面。强调的是通过相似变换将矩阵A转化为对角矩阵D。强调的是如何通过矩阵的特征值和特征向量来实现这种对角化。
rcsb.utils.seq-0.60 Python库功能与应用介绍
资源摘要信息:"Python库 rcsb.utils.seq-0.60.tar.gz 是一个适用于Python开发语言的压缩包文件，其中包含了版本号为0.60的特定模块或库。此资源全名为rcsb.utils.seq-0.60.tar.gz，这暗示了它可能与处理生物序列数据...
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