一、问题
在conda的DeepPurpose虚拟环境下安装rdkit包,使用
conda install -c conda-forge rdkit
二、分析原因
两个部分
一、collecting package metadata(repodata.json):failed
收集包失败,推测可能在conda-forge channel下没有这个包,或者没有适配的版本。
二、ProxyError: Conda cannot proceed due to an error in your proxy configuration.
conda没法运行由于代理的错误,这个错误可能是由于在执行conda命令时,我们打开了代理导致的,可以关闭代理再次尝试,看看有没有问题。
三、尝试办法
一、关闭代理
关闭代理再次执行 no
二、添加豆瓣源
添加豆瓣源,从我的经验来看,豆瓣源确实快
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/menpo/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/pytorch/
这里的conda-forge源有可能很关键。
添加了源,https换成http依然还是不行
三、使用离线创建命令
conda config --set offline true
然后再执行
conda install -c conda-forge rdkit
由上图可知,没有找到匹配的python版本。我的python版本是3.6,这里的conda是必须>=3.7,所以打断删除环境,重新建立一个python=3.8的版本。
conda create -n DeepPurpose3.8 python=3.8
然后再执行conda命令。
四、最终如何解决
简要总结
1.关闭代理
2.添加豆瓣的conda-forge源,源是http还是https不确定
3.根据提示改变python的版本,rdkit安装成功。