conda安装rdkit包出现的问题

文章描述了在conda的DeepPurpose环境中安装rdkit包遇到的问题,包括包收集失败和代理错误。作者尝试了关闭代理、添加豆瓣源、设置离线模式以及更改Python版本等方法,最终通过创建新的Python3.8环境成功安装了rdkit。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一、问题

在conda的DeepPurpose虚拟环境下安装rdkit包,使用

conda install -c conda-forge rdkit

请添加图片描述

二、分析原因

两个部分
一、collecting package metadata(repodata.json):failed
收集包失败,推测可能在conda-forge channel下没有这个包,或者没有适配的版本。
二、ProxyError: Conda cannot proceed due to an error in your proxy configuration.
conda没法运行由于代理的错误,这个错误可能是由于在执行conda命令时,我们打开了代理导致的,可以关闭代理再次尝试,看看有没有问题。

三、尝试办法

一、关闭代理

关闭代理再次执行 no

二、添加豆瓣源

添加豆瓣源,从我的经验来看,豆瓣源确实快

conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/menpo/
conda config --add channels https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/pytorch/

这里的conda-forge源有可能很关键。

在这里插入图片描述添加了源,https换成http依然还是不行

三、使用离线创建命令

conda config --set offline true

然后再执行

conda install -c conda-forge rdkit

在这里插入图片描述由上图可知,没有找到匹配的python版本。我的python版本是3.6,这里的conda是必须>=3.7,所以打断删除环境,重新建立一个python=3.8的版本。

conda create -n DeepPurpose3.8 python=3.8

然后再执行conda命令。

四、最终如何解决

简要总结
1.关闭代理
2.添加豆瓣的conda-forge源,源是http还是https不确定
3.根据提示改变python的版本,rdkit安装成功。

`solving environment unsuccessful` 是在使用conda管理器安装时可能会遇到的一个错误信息,通常意味着管理器在尝试解析依赖关系时遇到了问题RDKit是一个开源的化学信息学和机器学学习工具安装它时可能会出现这个错误,这可能是因为以下几个原因: 1. 网络问题:在安装过程中,conda需要从网上下载RDKit及其依赖的。如果网络连接不稳定,可能会导致下载失败或中断,从而无法正确解决环境。 2. 版本冲突:RDKit可能与其他已安装存在版本冲突。管理器需要找到一个兼容所有依赖项的版本组合,这在某些情况下可能无法做到。 3. 镜像源问题:如果使用的镜像源中没有所需的或者版本不全,也可能导致解决环境失败。 为了解决这个问题,你可以尝试以下几个步骤: 1. 检查网络连接,并确保conda可以访问网络资源。 2. 使用conda-forge通道安装RDKit,因为conda-forge通常有更新的版本。可以通过以下命令添加conda-forge通道并安装RDKit: ``` conda config --add channels conda-forge conda install rdkit ``` 3. 确保你的conda是最新版本,可以通过`conda update conda`来更新。 4. 如果问题依旧存在,可以尝试清理conda缓存,使用以下命令: ``` conda clean --all ``` 5. 另外,可以尝试创建一个新的环境来安装RDKit,以避免已有环境中的依赖冲突: ``` conda create -n new_env_name rdkit conda activate new_env_name ``` 6. 如果安装的是RDKit的开发版本,确保你有适当的开发工具和依赖库。
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