皮肤样本微生物的检测介绍

从公元前400年，希波克拉底第一次描述念珠菌感染起，研究者们一直在探究与人类共生的微生物对人体健康及疾病的影响。皮肤作为人体最大的器官拥有约1.8m２的表面积，其主要功能是作为物理屏障，保护机体免受外来生物或有毒物质的侵害。同时，皮肤也是人体与外界环境接触的部位，因此常驻有各类微生物，包括细菌、真菌、病毒等。如果将皮肤看作一个生态系统，那么它就是由各类微生物和皮肤表面的组织、细胞及各种分泌物等共同组成的整体。微生物群落与皮肤表面组织之间维持着动态的平衡，这种平衡一旦被打破，就可能会引起皮肤病或感染。

早期的皮肤微生物研究主要采用传统的分离培养方法，来识别和描述微生物群落的组成和多样性。传统方法的局限性使研究者难以正确全面地阐明皮肤微生物的群落结构和多样性特点。高通量测序从根本上改变了人们对微生物群落的认识，使人们得以系统地分析和认识皮肤微生物的群落及其功能。基于16S rRNA /ITS基因，优化实验方法，增加对痕量微生物的研究，利用二代测序技术（Roche 454、Illimina MiSeq/novaseq、Ion Torrent PGM）来分析皮肤微生物的多样性，为进一步理解皮肤微生物群落的结构特点及其与皮肤组织和环境的相互关系提供了研究渠道。

在分析微生物的群落组成时，必须要考虑到外源性微生物DNA污染的问题，在低生物量的样本中这个问题尤为重要。皮肤样本中的微生物量一般都很低，因此在设计实验的过程中，每一个步骤中都最好加入不含任何微生物DNA的空白样品作为对照，避免外源性污染导致分析结果出现偏差。以皮肤拭子样