基于核酸的分子生物学检测方法,如聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR),能够用于精准地分析样本中微生物的种类和丰度,但是难以区分微生物的存活状态。传统的用于检测样本中活细胞的方法都需要对样本进行培养,但是此类检测方法存在一定的局限性,无法用于检测一些难培养或是不可培养的活细胞。叠氮溴化丙锭(Propidium monoazide,PMA)是一种能与DNA结合的光反应染料,不具有细胞膜渗透性,无法穿透活细胞完整的细胞膜,只能选择性地穿透死细胞受损的细胞膜。进入细胞后,PMA会与DNA双螺旋发生共价交联,进而阻碍死细胞中目标DNA的PCR扩增,如图1所示。基于PMA的这一特性,通过对PMA处理过的样本进行PCR扩增和测序分析,即可得知样本中微生物的存活状态。
图1.PMA的作用原理示意图
现在已经有越来越多的文献报道采用了PMA-PCR或PMA-qPCR等方法对样本中的活细胞进行定性或定量分析,下面解读三篇文献。
文献一:Andreas N, Katherine ES, Anne KC. M