宏病毒组介绍

病毒是一种个体微小，结构简单，只含一种核酸（DNA 或 RNA），必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的非细胞型生物。病毒是地球上丰度最高的“生物”类群，它们广泛地存在于所有已知的生态环境中，从水体，土壤再到人体，病毒无处不在。病毒能够感染所有已知的生物类型，从动物、植物到微生物，包括细菌和古菌。

人体内的病毒主要包括真核病毒和噬菌体，按核酸类型，可分为双链DNA（double-stranded DNA，dsDNA）病毒，单链 DNA（single-stranded DNA ，ssDNA）病毒和RNA 病毒。

随着病毒研究的深入以及宏基因组学的快速发展，“宏病毒组”和“宏病毒组学”的概念应用而生。

宏病毒组学（Viral Metagenomics）是在宏基因组学理论的基础上，结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支。 宏病毒组直接以样本中所有病毒的遗传物质为研究对象，能够快速准确的鉴定样本中所有的病毒组成——也常被称为“病毒组（Virome）”。宏病毒组学应用广泛，可应用于人或动物肠道或者血液样本、水样、土壤样本等的研究。不仅在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用，在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。

宏病毒组研究始于 2002 年，Bretbart 等人利用宏基因组学技术研究了两个未培养的海洋病毒群落，发现噬菌体为海水中主要病毒类型。近年来，宏病毒组研究呈爆炸式增长，人们越来越意识到病毒在调节微生态平衡上发挥着重要作用。

但是由于受到传统病毒培养方法的限制，目前已知的病毒种类只有6000多种，而高通量测序技术的发展和广泛应用，越来越多的未知病毒被发现。定于2018年启动的“全球病毒组项目（Global Virome Project）”计划耗资12亿美元，旨在鉴定仍未“现身”的约百万种病毒（其中40%—50%的病毒可能感染人类），将宏病毒组研究推到了新的热潮。

在宏基因组数据中，宿主和细菌序列的占比高达99%，病毒只占到万分之几的水平。而直接提取环境或组织中宏病毒DNA或RNA序列的研究较少，且提取成功率也很低（通常不到1%）。

微基生物的宏病毒组技术路线如下

 

 

简言之