BODIPY脂滴染色流式荧光检测-Beckman流式仪-Summit流式数据分析软件

BODIPY脂滴染色流式荧光检测

探究在RA和OA的刺激下BMEC脂滴分泌的变化情况,之前因为共聚焦在区域选择方面认为影响因素较大,所以此次选用流式直接查看整体的分泌情况

  • 样品流水号对应设置浓度如下
1234567891011
OA100OA200OA300OA400OA500CONOA50OA100OA150OA200CON
  • 操作步骤如下

    • 吸出培养基,PBS清洗两遍
    • 400μL胰酶消化,1mL完全培养基终止消化,转移至1.5mL棕色避光EP管里
    • 1000rpm离心5min,弃上清
    • 每管加入1mL 1μg/mL的BODIPY室温避光染色15min
    • 离心,弃上清,PBS重悬离心弃上清,洗两到三遍
    • 400μL PBS重悬后上机
  • 流式下机数据处理

    • 在summit软件里导入.fsc文件后(设置为英文路径),双击右侧如下标志,在analysis中打开需要设置的第一个样品
      在这里插入图片描述

    • 第一步,调出细胞群

      • 所有细胞:左列为x轴,右列为y轴,选择后双击蓝色空白处
      image-20220121205030297
      • 有荧光强度的细胞

        image-20220121205759849
      • BODIPY-log荧光强度

      image-20220121210721012
    • 圈出细胞群,设门;右键-Polygon-圈目标群
      请添加图片描述
      在这里插入图片描述

    • 图一设的门圈至(挪至图2双击)图二,接着图二用rectangle方形圈门右键set gate移动至图三,图三则为圈到的信号强度。通过设门选取目的细胞,调整荧光信号形状对称性,去除杂信号等
      在这里插入图片描述

    • 设置好门后,在右侧菜单栏书本标志的analysis中选出其他样本进行比对

结果比较方法一
  • 按照上述步骤将样本信息一一导出后结果如下可利用Mean这一列的值做柱状图分析影响大小(我这次是预实验只是大概看一下所以没有设置复孔),如果浓度梯度有效果,配合共聚焦的荧光图一一对应放结果图里是最直观的
浓度流水号RegionCount% Hist% AllBoundsMode CountModeMeanMedianStd Dev.CVCV (hm)Skew
OA1001Total1704710034.29(1.00,100000.04)111753.1551.8848.5617.6333.9724.881.96
OA2002Total1549510022.92(1.00,100000.04)89063.6762.1660.8620.8133.4829.90.89
OA3003Total1615110028.42(1.00,100000.04)103253.1554.8153.1517.0531.1129.920.9
OA4004Total1588910025.23(1.00,100000.04)89960.8665.1863.6722.234.0634.091
OA5005Total1532210020.92(1.00,100000.04)78855.656.0953.1521.5738.4536.641.2
CON6Total1927410057.04(1.00,100000.04)159218.8220.1918.825.9229.3423.242.09
RA507Total1865310053.38(1.00,100000.04)112133.8435.5733.8412.6235.4831.281.99
RA1008Total1877410049.51(1.00,100000.04)122769.6869.2966.6123.1633.4326.031.52
RA1509Total1864210060.15(1.00,100000.04)138255.659.4455.618.6331.3423.241.7
RA20010Total1857510056.13(1.00,100000.04)131972.976.0572.923.9831.5324.671.54
CON11Total1891710043.65(1.00,100000.04)150424.6725.5524.677.5129.3823.241.69
结果比较方法二
  • 需要比对的样本按照上述方法(皆在Histogram下)一一从Databases samples目录下双击样本拉进来,按照上面的步骤选出三幅图的横纵坐标,然后设门这一步为保持一致性直接复制对照组的“门”进行set(比如我这里6号是对照组,就直接复制的6号的框选区域),比如我这里前两幅图都圈了门则都要一一复制,接下来用这3组数据(6/3/5示例)

  • 注意:一组样本要用同一组门才有可比性(所以按照第一步直接复制粘贴门)

  • 结果如下
    在这里插入图片描述

  • 因为我这里的目的是想看实验组与对照组相比,BODIPY的绿色荧光强度是否有变化(峰的偏移),所以在前面设门一致的条件下,将三个(这里示例用了三个)over在一起直接比较,以便直观看出。接下来进行overlay,左上角由Histogram切换到overlay之后,参照原来的第三幅荧光峰图,在Log Area选项下选择BODIPY-Log…之后同前一样双击蓝色空白处,出现新的图表框(此时是空白),单击新图标框的左上角,选择添加数据Add Data之后,双击每一组数据的第三幅图,也就是荧光强度值进行添加,就在新图表框中出现了下面我框选出来的红绿紫三个峰
    在这里插入图片描述

  • over完成之后如下,与红色对照6号样本相比,3号和5号样本都出现了明显的峰向右偏移,荧光强度增强,legend同样可以单击左上角调出
    在这里插入图片描述

  • 这个结果如果明显同样可以再做一个共聚焦一起看一下

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