微生物组测序方法比较

这里对标记基因、宏基因组以及宏转录组进行比较，见下表。如果实验目的是想获得微生物组较高水平、但分辨率较低的概述，首选标记基因测序。宏基因组测序可以通过分析样本中的总DNA而获得更多的细节，可以在菌株的水平上加以辨别，并提供更多的分子功能信息的基因。对于宏转录组测序，则是更多低用于描述微生物群落中的基因表达。

原文参考：Best practices for analysing microbiomes.https://www.nature.com/articles/s41579-018-0029-9
http://blog.sciencenet.cn/blog-3334560-1122300.html