RDKit | 天然产物的相似度评分(NP-likeness)

本文介绍了天然产物在药物发现中的重要性及其独特的结构特征,如稠密环结构、不对称中心和高氧原子比例。NP-likeness是一种衡量化合物与天然产物相似性的评分,范围在-5到5之间,数值越大,表示越可能为天然产物。利用RDKit的NP_Score工具,可以对化合物库进行评分和分析。
摘要由CSDN通过智能技术生成

        天然产物在药物发现的历史上占有非常重要的地位,许多药物仍然是天然产物及其衍生物。因此,过去大型制药公司都拥有“天然产物化学”部门,但是低通量天然产物的筛选逐渐变得无利可图并被关闭。

        与药物发现化学中通常合成的化合物相比,天然产物的结构特征为:

  • 许多稠密的环结构
  • 许多不对称中心
  • 芳香环更少,sp3碳更多
  • 氧原子百分比高,氮原子百分比低

 

天然产物化合物的特征

为了将“ 天然产物相似性

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