RDKit内置功能绘制分子结构的函数,可根据rdkit.Chem.Draw
包创建分子图像
方法一:基于SMILES输出分子2D图(2D image)
导入库
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem import rdDepictor
载入smiles数据
mol = Chem.MolFromSmiles('CCC(CC)O[C@@H]1C=C(C[C@@H]([C@H]1NC(=O)C)[NH3+])C(=O)OCC')
计算2D坐标
rdDepictor.Compute2DCoords(mol)
输出分子图</