Freesurfer是用于MRI图像处理和分析的一款开源软件,可以进行多种模态数据的预处理、皮层重建、volume与surface的互相 之间的配准等。
Freesurfer许多功能都可以利用软件包中集成好的pipeline来实现,可以参考官网进行了解,也可以调用一些单独的命令来实现自己的需求,比如查看.mgz/.nii.gz等格式文件的信息时用到的mri_info等。
具体介绍可以参考官网:FreeSurfer,或者豆瓣上一个科技科普类的专栏(中文):FreeSurfer使用手册
Freesurfer学习推荐:
1. 利用搜索引擎搜索,但是由于中文资料较少,所以作为了解以及补充知识还可以,如果是实际使用中遇到问题的话能够搜索到的资料可能较少,而且部分邮件内容来自于第三条所列举到的mailing list。
2. 查看官方文档说明,可以了解软件各个指令的功能。或者在使用中多多利用shell中的`--help` 参数进行了解。
比如想要了解mri_info命令的使用方法,就可以在Ubuntu1404的Terminal中输入:
$mri_info --help
或者在