数据原理
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很酷的女超人
生信研究僧
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数据原理——1、ChIP-seq
一、chip-seq(研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法)一个染色质1、调控染色质形态:组蛋白修饰、染色质重塑、DNA甲基化2、作用机制1、用交联剂,把与DNA互作的蛋白固定住,防止在两到三天的实验中,从染色质上脱落2、用抗体识别并结合染色质上的靶蛋白3、纯化富集靶蛋白4、靶蛋白脱离下来5、解交联,使蛋白和DNA分离6、纯化DNA7、得到所有与靶蛋白结合的DNA片段3、三种类型组蛋白:组蛋白、转录因子①组蛋白与DNA的结合是结构性的,结合强度非常大,分度高,是最容易做的蛋白②原创 2021-06-10 16:26:16 · 6325 阅读 · 1 评论 -
数据原理——2、ChIA-PET
一、背景介绍利用成对末端标记序列(ChIA-PET)进行染色质相互作用分析是一种将功能染色质结构转化为数百万个短标记序列的方法配对末端标签测序ChIA-PET技术应用了PET测序技术的基本原理。PET测序技术的独特之处在于构建配对末端测序模板。从目的DNA片段两个末端提取短标签并将它们配对构成一个PET,对PET进行高通量测序,利用标签序列定位目的DNA片段在基因组中的位置。为了获得短标签,将目的DNA片段两个末端分别与设计好的半连接子(linker)相连。半连接子为具有MmeI限制性内切酶识别位点的原创 2021-07-10 13:00:15 · 3959 阅读 · 0 评论