Metastats组间差异分析
Metastats组间差异分析与LEfSe类似,也是多用于寻找不同区组中微生物群落差异物种的一种工具。Metastats实际上是非参数多重检验和p值校正的整合,它对所有物种按照分组进行显著性检验,对数据集进行多重检验,则需要p值校正来获得更准确的结果。TUTU网站提供热图的形式实现Metastats组间差异分析结果可视化。
应用举例
Figure 4.三个实验组中特定 OTU 的相对丰度差异。Metastats 模型应用于 25 个最丰富的 OTU,频率 >99%。三个实验组被表示为 SSc/GI+(具有确定的 SSc 和胃肠道症状的患者)、SSc/GI-(无胃肠道症状的 SSc 患者)和 HC(健康对照)。显着差异用不同的小字母突出显示(P < 0.05)。(Gut microbiota profile in systemic sclerosis patients with and without clinical evidence of gastrointestinal involvement)
Figure 4.通过 Metastats 分析确定并在门级别总结的大西洋鲑鱼(淡水前蜕皮鱼和海水后蜕皮鱼)的肠道微生物操作分类单元 (OTU) 特征。沿 y 轴的丰度百分比是指特征 OTU 被分类映射到的门的相对比例。(Seawater t