派森诺基因云自从发布以来,一直以简单的操作、高颜值的图片和良好的体验感深受广大老师和同学们的喜爱。其中的云图汇模块,不仅提供了数据统计分析和可视化作图功能,“所见即所得”,同时也成为了PPT制作、组会汇报、文章写作作图、甚至是基金申请作图的利器!
差异统计检验是科学研究的重要组成部分,其分析结果可用于检验我们实验结果的真实性、准确性和可重复性。云图汇最近推出的差异检验箱线图,理论上可用于任何数据的差异检验分析。
对于微生物组研究,除了使用箱线图比较不同样本组间,Alpha多样性指数的差异大小,我们还可以对不同物种的丰度或功能基因的含量进行组间差异统计检验,从而获得组间具有显著差异的物种组成和功能基因。这类分析,都可以在云图汇中,一键完成哦~
手把手教您绘制箱线图,比较组间差异物种
步骤1
首先,我们需要从云分析模块中,下载菌群的物种组成丰度表。我们在云平台上提供了两种下载途径:
- 点击进入“序列处理分析→物种分类学注释”,选择“表(Tables)”标签,并在页面下方选择“点击下载各分类学水平下的分类单元丰度表”,下载后解压即可获得各分类学水平下的分类单元丰度表,包含门/纲/目/科/属/种各个分类水平下的物种组成和丰度数据表(.xls文件)。
通过“物种分类学注释”下载获得的各分类学水平下的分类单元丰度表
- 依次点击进入“物种差异与标志物种分析→物种组成热图”,选择“表(Tables)”标签,点击右上角“下载按钮→下载xls文件”,获得“分类单元丰度表.xls”,从而获得在指定分类水平下(默认为属水平,可以按需调整)