linux下载测序数据,利用SRA号从NCBI下载测序原始数据

生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方式见测序文章数据上传找哪里；并在文章末尾标明数据存储位置和登录号,如 The data from this study was deposited in NCBI Sequence Read Archive under accession SRA: SRP114962.。

NCBI的SRA (Sequence Read Archive) 数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/) 是最常用的存储测序数据的数据库。目前SRA数据的组织方式分为下面4个层次：

Studies–研究课题；

Experiments–实验设计；

Runs–测序结果集；

Samples–样品信息。

进入SRA官网：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra, Search框中输入SRA编号(SRP114962)，获得如下图的界面：

点击第一个样品即可查看其详细信息。

当样品比较多时，可以点击Send results to Run selector(图中画圈的位置)进入筛选页面。

从图中可发现，测序平台是Il