linux上传数据到sra,通过Linux命令行使用Aspera全速上传测序数据到NCBI数据库

每试错一次，就离本质就更近一步。----小蓝哥

为什么要上传数据

师姐找我帮忙上传宏基因组数据到NCBI，大概是45G。NCBI提供了很多种可供选择的上传方式：

多丰富多彩的上传方式

没有海外节点 + 学校的龟速网速，网页上传的速度可想而知，ftp又很容易断，据说Aspera上传能够达到满速上传，就想试一下。

Aspera有浏览器插件，下载试了几次都不行。决定试一下命令行方式。前前后后上传了大约100G数据，终于把这种满速上传数据的方法掌握了。

命令行方式分成Windows下的方式和Linux命令行模式，Windows还需要配制环境变量，比较麻烦，索性采用Linux命令行上传。

电脑配置

Oracle VM VirtualBox 虚拟机配Ubuntu 18.0操作系统 + FinalShell。虚拟机当个小服务器，FinalShell是国产的Shell，目前接触过的Shell中比较好用的。

界面是长这样的

软件准备

第一步是get到Aspera的Linux版本：