FASTQ 文件格式转换为 FASTA 格式

1.利用Linux命令：awk

2.用法如下：

awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' fastq > fasta

3.上述用法注意事项：

fastq文件必须是解压格式的，不能是gz后缀的，虽然命令也能正常运行，但是查看文件的时候，

发现里面的内容都是乱码的。

 

Ps：现在想想，Linux有些命令还是挺强大的。

比如：awk、tr、sed等，有空还是要学一下的

 

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