本文以银杏为研究对象，通过转录组测序分析了花粉室形成前后的差异表达基因（DEGs），涉及细胞程序性死亡（PCD）相关通路。PCA和GO分析揭示了DEGs的功能，特别是乙烯信号途径在PCD中的作用。作者还进行了RT-qPCR验证和蛋白质互作网络分析，证实了转录组结果的可靠性。此外，钙离子细胞定位实验进一步证实其在PCD调控中的关键角色。
随着高通量测序技术的发展，越来越多的研究者或多或少的做了一些测序项目，其中尤以转录组测序类最多。
今天小编就给大家带来一篇2月28日发表在BMC Plant Biology(影响因子3.93，中科院分区二区)上的转录组测序文章。
该文章总的来说是转录组测序分析+荧光定量PCR验证+少量的实验，思路清晰，设计简单，值得借鉴！
本文以银杏为实验材料，在取样之前，作者通过显微镜观察，来确认银杏胚珠花粉室形成过程中的各个阶段，从而确认取样时间点为花粉室形成前和形成后两个时间点，各3个生物学重复，共6个样品用于转录组测序分析。
为了评估样品的生物学重复的可靠性，作者做了PCA分析和相关性分析。
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