rna聚类分析_看这里，你所需要的RNA-seq建库方法以及数据分析

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RNA-seq的建库及分析

1RNA-seq的应用

RNA-seq是目前所有高通量测序中应用最广的一种测序方法，可以应用于一下几个方面；

在各种比较情况下（比如正常组织与肿瘤组织之间），所有基因的表达差异变化

mRNA表达亮的差异

mRNA结构上的差异（可变剪接

融合基因、点突变（SNP）

2

RNA-seq的方法

在检测mRNA的过程中，我们首先需要解决的问题就是mRNA纯度的问题，换句话说，我们要去除总RNA中的rRNA，因为rRNA占提取的总RNA量的95%以上。

所以，从上图中我们可以看出，如果我们拿总的RNA去测序，我们测到的数据大部分是rRNA。然而，我们知道的是，rRNA在我们人体中是高度保守的，也就是无论你是否患有某种疾病，rRNA的测序结果都是一样的，这样就对我们科研人员来说测序结果将毫无意义！而mRNA是所有RNA中信心含量最丰富的那一部分。因此，我们在测序之前首先要做的就是纯化mRNA，再进行建库测序。

3rRNA去除以及建库

目前最常用的就是Illumina公司的Truseq RNA建库方法。