bcftools配置失败:FAQ
问题描述
安装bcftools,步骤如下:
wget
https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.9/bcftools-1.9.tar.bz2
sudo tar -xjf bcftools-1.9.tar.bz2
cd bcftools-1.9/
sudo ./configure
报错信息:configure: error: libbzip2 development files not found,具体如下图:
解决办法:安装 bzip2-devel,命令如下:
sudo yum install bzip2-devel
再次执行:sudo ./configure
报错如下图:configure: error: liblzma development files not found
解决办法:
安装liblzma包:
#ubuntu系统安装
apt-get install liblzma-dev
#centos系统
sudo yum install xz-devel
继续安装bcftools
sudo ./configure
sudo make
sudo make install
测试软件是否安装成功
./bcftools #显示帮助信息则安装成功
设置环境:
ln -s /安装路径/bcftools /bin/bcftools
安装完成!